RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 RNLSQ5VYX0 342 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 LAIR1Q6GTX8 287 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 OR56B4Q8NH76 319 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 FGGYQ96C11 551 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 OR2M2Q96R28 347 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 LINC01553A4QN01 128 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 H0YGG7 62 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 TFP02787 698 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CLEC3BP05452 202 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CT45A6P0DMU7 189 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CT45A5P0DMU8 189 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CT45A7P0DMV0 189 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CT45A8P0DMV1 189 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CT45A9P0DMV2 189 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CT45A1Q5HYN5 189 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 RTL6Q6ICC9 239 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 LINC00696Q6ZRV3 163 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CT45A3Q8NHU0 189 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 ABHD4Q8TB40 342 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SLC38A1Q9H2H9 487 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 DUSP22Q9NRW4 184 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 FFAR1O14842 300 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 FZD7O75084 574 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 PNPP00491 289 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 GYPBP06028 91 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 EVX1P49640 407 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SNU13P55769 128 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 MPPED2Q15777 294 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 MPEG1Q2M385 716 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 BAGE3Q86Y29 109 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 BAGE2Q86Y30 109 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 OR52R1Q8NGF1 315 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 MSLNLQ96KJ4 702 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 INIPQ9NRY2 104 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 FCMRO60667 390 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SLC2A1P11166 492 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 UGT2B7P16662 529 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 FXYD4P59646 89 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 PCBD1P61457 104 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 PMPCAQ10713 525 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 DUSP5Q16690 384 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 ZMAT1Q5H9K5 638 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 AWAT2Q6E213 333 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 LEG1Q6P5S2 330 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 OR1J2Q8NGS2 313 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SLC35B4Q969S0 331 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SDF2Q99470 211 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 PRRT1Q99946 306 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 IER2Q9BTL4 223 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CBY1Q9Y3M2 126 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 NID1P14543 1247 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 EPHA1P21709 976 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 UBE2KP61086 200 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CRMP1Q14194 572 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 FAM69AQ5T7M9 428 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 IL20RBQ6UXL0 311 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 PPM1DO15297 605 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 SCO1O75880 301 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 OR2T7P0C7T2 308 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 MGST1P10620 155 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 TGM4P49221 684 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 BTG1P62324 171 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 DUSP8Q13202 625 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 MEF2DQ14814 521 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 HMGN3Q15651 99 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRG-201ENST00000295874 TSSK4Q6SA08 328 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms