RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 ACKR4Q9NPB9 350 aa22.38■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 TRAV27A0A087WT01 109 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1W2PPE3 182 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 C1orf196B1AJZ1 125 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 TXNL1O43396 289 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 LDB3O75112 727 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SLC25A4P12235 298 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 CASRP41180 1078 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ACTA2P62736 377 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ACTG2P63267 376 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF425Q6IV72 752 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 OR51L1Q8NGJ5 315 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SFXN5Q8TD22 340 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 OR2AT4A6NND4 320 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 WRBO00258 174 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 CTSVO60911 334 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 RCBTB2O95199 551 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF3P17036 446 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ABCD3P28288 659 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 FABP9Q0Z7S8 132 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 FRRS1Q6ZNA5 592 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 LRRTM1Q86UE6 522 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 NRROSQ86YC3 692 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 OR5M8Q8NGP6 311 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 OR8S1Q8NH09 359 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 OR4C6Q8NH72 309 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 PATE1Q8WXA2 126 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 PHYHIPQ92561 330 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 IDSB3KWA1 339 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 FARS2O95363 451 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 PMS2P2O95744 297 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 AKAIN1P0CW23 69 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 RUNX2Q13950 521 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 DUSP5Q16690 384 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 A0A087WV48 116 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 PRR19A6NJB7 356 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 MBTPS2O43462 519 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 CD3DP04234 171 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 RD3LP0DJH9 198 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SELLP14151 372 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 PVRP15151 417 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 POU4F2Q12837 409 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 TMED4Q7Z7H5 227 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 OR51A7Q8NH64 312 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SEC22AQ96IW7 307 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SPSB2Q99619 263 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 TCEAL7Q9BRU2 100 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ADAP2Q9NPF8 381 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 TAS2R8Q9NYW2 309 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 COMMD9Q9P000 198 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 NCDNQ9UBB6 729 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1B0GTI1 187 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SULT2B1O00204 365 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 CCSO14618 274 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 GPR89BP0CG08 455 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 IER2Q9BTL4 223 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SRMSQ9H3Y6 488 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SIGLEC7Q9Y286 467 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 CD1AP06126 327 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 CD79AP11912 226 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ACTR1BP42025 376 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ACTR1AP61163 376 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF836Q6ZNA1 936 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM239Q8WW34 195 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 FAM96BQ9Y3D0 163 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 XRCC3O43542 346 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 GPRIN2O60269 458 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ITGB2P05107 769 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ADRA2CP18825 462 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF136P52737 540 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 CAPZA1P52907 286 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 ATP1B3P54709 279 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 RNF212Q495C1 297 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 MFSD12Q6NUT3 480 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 STAC2Q6ZMT1 411 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 MRI1Q9BV20 369 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-201ENST00000294964 WDR45Q9Y484 360 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms