RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281821.6

EPHA4-201, Transcript of EPH receptor A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EPHA4, Length 6,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4-201ENST00000281821 CD97P48960 835 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 TMBIM6P55061 237 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 POU4F3Q15319 338 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 TGIF1Q15583 401 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 GPR107Q5VW38 600 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 CDH24Q86UP0 819 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 MCFD2Q8NI22 146 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ASCL3Q9NQ33 180 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 SLC35F4A4IF30 521 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ASPDHA6ND91 283 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 GASTP01350 101 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 F13BP05160 661 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 DBTP11182 482 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 RASD2Q96D21 266 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ZAR1LA6NP61 321 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 TNFRSF1BP20333 461 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 GLP1RP43220 463 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 C19orf57Q0VDD7 668 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 CRMP1Q14194 572 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 NKPD1Q17RQ9 610 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 VASNQ6EMK4 673 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 KLBQ86Z14 1044 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF101Q8IZC7 436 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 Q96M85 177 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 GNRHR2Q96P88 292 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 A4GNTQ9UNA3 340 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 QDPRP09417 244 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 CD36P16671 472 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 RAB3AP20336 220 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 S100A1P23297 94 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF691Q5VV52 312 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 SPINK14Q6IE38 97 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 SYT14Q8NB59 555 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 C16orf97H3BN30 126 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 SLC19A2O60779 497 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 CELP19835 753 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 CDK5R2Q13319 367 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 LIPHQ8WWY8 451 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 TMEM45BQ96B21 275 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 RAD51DO75771 328 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 PRSS23O95084 383 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 Q6ZS92 163 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 VOPP1Q96AW1 172 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 DIRC2Q96SL1 478 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 KLK13Q9UKR3 277 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 RNF6Q9Y252 685 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 CLPXO76031 633 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 UQCRC1P31930 480 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 TGFBR2P37173 567 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 XKRXQ6PP77 449 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 AMBNQ9NP70 447 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 A0A1W2PNR3 127 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 TMEM72A0PK05 275 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 DOK2O60496 412 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 CPN1P15169 458 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHA4-201ENST00000281821 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms