RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 A4GNTQ9UNA3 340 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NOTCH2Q04721 2471 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GX78 115 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMEM82A0PJX8 343 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TSPAN11A1L157 253 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 A8MVM7 634 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PEX14O75381 377 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 EPHA4P54764 986 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 AKR1C1Q04828 323 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GPR176Q14439 515 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 XAF1Q6GPH4 301 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PXKQ7Z7A4 578 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TPRA1Q86W33 373 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TDHQ8IZJ6 230 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CA13Q8N1Q1 262 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR51S1Q8NGJ8 323 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CMC2Q9NRP2 79 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MED17Q9NVC6 651 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DUSP13Q9UII6 198 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ASB4Q9Y574 426 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 A0A0B4J2A0 478 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR2J2O76002 312 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GLCEO94923 617 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PMP2P02689 132 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SERPINE2P07093 398 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RAB6AP20340 208 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 S100A2P29034 98 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CAMLGP49069 296 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 NPY4RP50391 375 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OXA1LQ15070 435 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CBLN3Q6UW01 205 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 THSD4Q6ZMP0 1018 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF709Q8N972 641 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR4Q3Q8NH05 313 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR52N1Q8NH53 320 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLC7A6Q92536 515 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLAMF9Q96A28 289 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SDSLQ96GA7 329 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SUCNR1Q9BXA5 334 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OR10A2Q9H208 303 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 RGCCQ9H4X1 137 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 KLK11Q9UBX7 282 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DOCK6Q96HP0 2047 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ATAD5Q96QE3 1844 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BLACEA4D250 179 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 UBL3O95164 117 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ABHD16AO95870 558 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CBX7O95931 251 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ATP1B1P05026 303 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 CSF1P09603 554 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ADH6P28332 368 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 AGTR1P30556 359 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 OPRM1P35372 400 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DCAF7P61962 342 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 DUSP8Q13202 625 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 BTN1A1Q13410 526 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GALEQ14376 348 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 VN1R4Q7Z5H5 301 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 SULF2Q8IWU5 870 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 MKXQ8IYA7 352 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms