RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Angptl8Q8R1L8 198 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem123Q91Z22 195 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc25a37Q920G8 338 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mettl15Q9DCL4 406 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CymB7ZWD6 379 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cyp4a31F8WGU9 509 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klhl9Q6ZPT1 617 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hs6st2Q80UW0 612 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Galnt6Q8C7U7 622 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rasgef1bQ8JZL7 473 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NagsQ8R4H7 527 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1079Q8VF52 315 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr644Q8VH21 314 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rbms1Q91W59 403 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sf3b5Q923D4 86 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnps1Q99M28 305 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tm7sf3Q9CRG1 565 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Serinc1Q9QZI8 453 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PvrigA0A1B0GS01 234 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm17615E9Q9P2 165 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prps1l3G3UXL2 318 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Stmn3O70166 180 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 H2-D1P14427 368 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcd3P55096 659 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Yipf3Q3UDR8 347 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bbs12Q5SUD9 708 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppp2r2bQ6ZWR4 443 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr645Q7TRQ1 315 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tbl1xr1Q8BHJ5 514 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fbxw19Q8C2W8 466 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 A730049H05RikQ8C940 139 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Uck2Q99PM9 261 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdca5Q9CPY3 264 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prps1Q9D7G0 318 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tagln3Q9R1Q8 199 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr292F8VQ84 308 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm8660K7N6J2 305 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn2r47K7N709 852 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igf2P09535 180 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pex2P55098 305 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SctrQ5FWI2 447 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Thnsl2Q80W22 483 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam131aQ8BWU3 361 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdc123Q8CII2 336 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eddm3bQ8K0E4 149 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trib3Q8K4K2 354 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dcp1aQ91YD3 602 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 2410004P03RikA0A087WQY2 205 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1337A2ACY8 315 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn2r48E9Q5D8 855 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MndaP0DOV1 425 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ifi204P0DOV2 619 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc106Q3ULM0 279 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dhrs9Q58NB6 319 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Steap3Q8CI59 488 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wasf3Q8VHI6 501 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slco1a5Q91YY5 670 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tex33Q9D9J2 266 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adam28Q9JLN6 793 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr228A0A1L1SR98 313 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 4930522L14RikE9QAG4 666 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SgcbP82349 320 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 FarsaQ8C0C7 508 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm39566A0A1B0GT45 1251 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 JhyE9Q793 770 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r121K7N6J4 314 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Socs1O35716 212 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Socs2O35717 198 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dynlrb1P62627 96 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MestQ07646 335 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CbfbQ08024 187 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdr75Q3U821 830 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hephl1Q3V1H3 1159 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ei24Q61070 340 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Iqcf4Q6P8Y2 204 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Smarcd3Q6P9Z1 483 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plekhm1Q7TSI1 1074 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mgat4bQ812F8 548 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp9Q8BIS1 454 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tigd4Q8BUZ3 513 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mrgpra1Q91WW5 304 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GmppaQ922H4 420 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chchd3Q9CRB9 227 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Asf1bQ9DAP7 202 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spata19Q9DAQ9 154 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nusap1Q9ERH4 427 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cryba2Q9JJV1 197 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc7a8Q9QXW9 531 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mfsd13bA0A1L1SUA2 455 aa27.07■■□□□ 1.92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cd300cA2A7V7 229 aa27.07■■□□□ 1.92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ElnP54320 860 aa27.07■■□□□ 1.92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc25a35Q5SWT3 300 aa27.07■■□□□ 1.92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp866Q6PGD2 520 aa27.07■■□□□ 1.92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pqlc3Q8C6U2 202 aa27.07■■□□□ 1.92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Thap1Q8CHW1 210 aa27.07■■□□□ 1.92
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 OxsmQ9D404 459 aa27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.2 ms