RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627441.2

SPTAN1-212, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-212ENST00000627441 GFAPP14136 432 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 CRHR1P34998 444 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 PGM1P36871 562 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 HTR5AP47898 357 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 THBS3P49746 956 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 HTR6P50406 440 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC12A2P55011 1212 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 BTKQ06187 659 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 BNIP2Q12982 314 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 MAPK14Q16539 360 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 MOGQ16653 247 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF627Q7L945 461 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 PIFOQ8TCI5 191 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 LYZL4Q96KX0 146 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 DUX3Q96PT4 197 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 FOXB1Q99853 325 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF649Q9BS31 505 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ACPTQ9BZG2 426 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 BRF2Q9HAW0 419 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 GCM1Q9NP62 436 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.51□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF208O43345 1280 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 UGT2B17O75795 530 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 UBL3O95164 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 SNAP29O95721 258 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 HSPA4LO95757 839 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 IFI6P09912 130 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 PSMB10P40306 273 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ELK3P41970 407 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 CRATP43155 626 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 GPR68Q15743 365 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 OR2V2Q96R30 315 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 SH3GL3Q99963 347 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ASPNQ9BXN1 380 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 PIGUQ9H490 435 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.5□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 HDAC3O15379 428 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 LY86O95711 162 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 INHBAP08476 426 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 HCKP08631 526 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 STMN1P16949 149 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 TNFRSF1AP19438 455 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 CPT2P23786 658 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 STX2P32856 288 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 PMELP40967 661 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ERFP50548 548 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 BLCAPP62952 87 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 IL5RAQ01344 420 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 MGAT5Q09328 741 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF141Q15928 474 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 TMEM219Q86XT9 240 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 VRK2Q86Y07 508 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 PTOV1Q86YD1 416 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 EGLN2Q96KS0 407 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 STACQ99469 402 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 EMC6Q9BV81 110 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 SCOCQ9UIL1 159 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 PCTPQ9UKL6 214 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 MANBAO00462 879 aa6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 RAD51CO43502 376 aa6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 OR4F21O95013 312 aa6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-212ENST00000627441 LIPFP07098 398 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms