RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 CALB2P22676 271 aa23.43■■□□□ 1.34
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BRD4-208ENST00000597315 SMIM11AP58511 58 aa23.43■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 CTXN1P60606 82 aa23.43■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.345e-7■□□□□ 10.5
BRD4-208ENST00000597315 CD47Q08722 323 aa23.43■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 TBPL2Q6SJ96 375 aa23.43■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 MCHR2Q969V1 340 aa23.43■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 ZNF347Q96SE7 839 aa23.43■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 CACNG6Q9BXT2 260 aa23.43■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 FBXL3Q9UKT7 428 aa23.43■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa23.43■■□□□ 1.34
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BRD4-208ENST00000597315 TRAV27A0A087WT01 109 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 A0A1W2PRQ8 180 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 FUT4P22083 530 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 RPL4P36578 427 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 MYBPC1Q00872 1141 aa23.42■■□□□ 1.34
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BRD4-208ENST00000597315 FXNQ16595 210 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 LRFN4Q6PJG9 635 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 SLC22A24Q8N4F4 322 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 FAM86B1Q8N7N1 296 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 SLC7A13Q8TCU3 470 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 C7orf34Q96L11 122 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 TMEM38BQ9NVV0 291 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 AURKCQ9UQB9 309 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 USF3Q68DE3 2245 aa23.42■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 CELA3BP08861 270 aa23.41■■□□□ 1.34
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BRD4-208ENST00000597315 FAM205BPQ63HN1 556 aa23.41■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 PODNL1Q6PEZ8 512 aa23.41■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 VHLLQ6RSH7 139 aa23.41■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.41■■□□□ 1.34
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BRD4-208ENST00000597315 FBXO17Q96EF6 278 aa23.41■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 RBP7Q96R05 134 aa23.41■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa23.41■■□□□ 1.34
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BRD4-208ENST00000597315 RNF121Q9H920 327 aa23.41■■□□□ 1.34
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BRD4-208ENST00000597315 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 DIRAS1O95057 198 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 FABP3P05413 133 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 ACVR1BP36896 505 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 GIPRP48546 466 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 SPIBQ01892 262 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 RUNX1T1Q06455 604 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 RAB35Q15286 201 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 ZBED5Q49AG3 693 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 ARMC4Q5T2S8 1044 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa23.4■■□□□ 1.34
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BRD4-208ENST00000597315 IGFN1Q86VF2 1251 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 OR52J3Q8NH60 311 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 FNDC8Q8TC99 324 aa23.4■■□□□ 1.34
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BRD4-208ENST00000597315 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 CA10Q9NS85 328 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 C2CD3Q4AC94 2353 aa23.4■■□□□ 1.34
BRD4-208ENST00000597315 A6NIZ1 184 aa23.39■■□□□ 1.33
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BRD4-208ENST00000597315 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 RAP1BP61224 184 aa23.39■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 RAP1AP62834 184 aa23.39■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 HIST3H3Q16695 136 aa23.39■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 CLEC12BQ2HXU8 276 aa23.39■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 TMEM53Q6P2H8 277 aa23.39■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 SKA3Q8IX90 412 aa23.39■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 SEC61A2Q9H9S3 476 aa23.39■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 DLL4Q9NR61 685 aa23.39■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.39■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa23.38■■□□□ 1.33
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BRD4-208ENST00000597315 OR4K5Q8NGD3 323 aa23.38■■□□□ 1.33
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BRD4-208ENST00000597315 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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BRD4-208ENST00000597315 MUC13Q9H3R2 512 aa23.38■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 SMURF2Q9HAU4 748 aa23.38■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 ACTR3BQ9P1U1 418 aa23.38■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 GRHPRQ9UBQ7 328 aa23.38■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 TRIM64A6NGJ6 449 aa23.37■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 TRIM64BA6NI03 449 aa23.37■■□□□ 1.33
BRD4-208ENST00000597315 FAM171A2A8MVW0 826 aa23.37■■□□□ 1.33
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