RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589864.1

TNNI3-208, Transcript of troponin I3, cardiac type, human

TSL 2

Gene TNNI3, Length 525 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNI3-208	ENST00000589864	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	CCL17	Q92583	94 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM54	Q969K7	222 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	SORT1	Q99523	831 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	RNF121	Q9H920	327 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	VWF	P04275	2813 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	PLPP3	O14495	311 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	BIRC5	O15392	142 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	MFN2	O95140	757 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	ANP32D	O95626	131 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	AHCY	P23526	432 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	HTR2A	P28223	471 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	OR6X1	Q8NH79	312 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	SH3GL3	Q99963	347 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	OR51B6	Q9H340	312 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	GLTP	Q9NZD2	209 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TNNI3-208	ENST00000589864	ISPD	A4D126	451 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	UBOX5	O94941	541 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ETS2	P15036	469 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	MAK	P20794	623 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC1A6	P48664	564 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	BID	P55957	195 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF154	Q13106	437 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	BBS10	Q8TAM1	723 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	MMP26	Q9NRE1	261 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	DHH	O43323	396 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	IGHV1-46	P01743	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ADH4	P08319	380 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	MMP15	P51511	669 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	PLP2	Q04941	152 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	RGN	Q15493	299 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC36A2	Q495M3	483 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	RMND5A	Q9H871	391 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	NOTCH1	P46531	2555 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A1B0GUS0	222 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	PLSCR5	A0PG75	271 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	SDHD	O14521	159 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	TM9SF1	O15321	606 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	SPRY3	O43610	288 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	MGRN1	O60291	552 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	SERPINI2	O75830	405 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	IGHM	P01871	453 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	BMP2	P12643	396 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF12	P17014	697 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	MTNR1A	P48039	350 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	LEG1	Q6P5S2	330 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		13.87	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms