RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.78□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ATG4D-210ENST00000588972 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 SMIM30A4D0T7 59 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 PINLYPA6NC86 204 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 UPK1AO00322 258 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 C6orf47O95873 294 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CT45A8P0DMV1 189 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CT45A9P0DMV2 189 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 PRPS1L1P21108 318 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 IL12AP29459 219 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 AMTP48728 403 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 KHKP50053 298 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 IST1P53990 364 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 AQP5P55064 265 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 FBXW4P57775 412 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 TFF3Q07654 80 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CBX3Q13185 183 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 TNK1Q13470 666 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CPTPQ5TA50 214 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 EPGNQ6UW88 154 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 KCTD9Q7L273 389 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 OR2L13Q8N349 312 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 VSTM2LQ96N03 204 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 Q9N2K0 584 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 PRODH2Q9UF12 536 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 HCFC1P51610 2035 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 COL6A5A8TX70 2615 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PRB8 838 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 FRG2CA6NGY1 282 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 E9PBE3 544 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 PLOD2O00469 737 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 DVL1O14640 695 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 ZNHIT1O43257 154 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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ATG4D-210ENST00000588972 CSN3P07498 182 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CHRNB4P30926 498 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 DNASE1L1P49184 302 aa6.76□□□□□ -1.33
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ATG4D-210ENST00000588972 C21orf58P58505 322 aa6.76□□□□□ -1.33
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ATG4D-210ENST00000588972 MYBPHQ13203 477 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 OPN5Q6U736 354 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 RTL4Q6ZR62 310 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD46Q86W74 232 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 OR2M7Q8NG81 312 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 ASB5Q8WWX0 329 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 NRGNQ92686 78 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 TMBIM1Q969X1 311 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 OMA1Q96E52 524 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 GIMAP5Q96F15 307 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 BTBD9Q96Q07 612 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CFL2Q9Y281 166 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 ATRQ13535 2644 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 C17orf51A8MQB3 221 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 FAM166BA8MTA8 275 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM178BH3BS89 294 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 UBDO15205 165 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CFLARO15519 480 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 UGT2B11O75310 529 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 C1QCP02747 245 aa6.75□□□□□ -1.33
ATG4D-210ENST00000588972 P04436 131 aa6.75□□□□□ -1.33
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