RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 BOD1Q96IK1 185 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 LRR1Q96L50 414 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 PRRC1Q96M27 445 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF347Q96SE7 839 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 OR51B6Q9H340 312 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF121Q9H920 327 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 INIPQ9NRY2 104 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 V9GYQ6 96 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 VSTM5A8MXK1 200 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 UBL3O95164 117 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 FARS2O95363 451 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 PGA4P0DJD7 388 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 PGA3P0DJD8 388 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 NPR2P20594 1047 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 LSP1P33241 339 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 GSK3BP49841 420 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 DAP3P51398 398 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF84P51523 738 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 EFNA4P52798 201 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 GYS2P54840 703 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB1AP62820 205 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SELENOWP63302 87 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 HGFACQ04756 655 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ZP4Q12836 540 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 GGTLC2Q14390 218 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB39AQ14964 217 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 IFI44LQ53G44 452 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 HDDC2Q7Z4H3 204 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 IGFN1Q86VF2 1251 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC36Q8IYA8 594 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 NSMAFQ92636 917 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM54Q969K7 222 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SH3GL3Q99963 347 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 PLK3Q9H4B4 646 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ADA2Q9NZK5 511 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 FZR1Q9UM11 496 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 B9A039 149 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 DHHO43323 396 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 GPRIN2O60269 458 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 GMNNO75496 209 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC2A10O95528 541 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 CSF3P09919 207 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 THRBP10828 461 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 PDLIM4P50479 330 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 DSCR9P59020 149 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 PSME3P61289 254 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 GNGT1P63211 74 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 RUNX1T1Q06455 604 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 MST1LQ2TV78 715 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ALG10Q5BKT4 473 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SKA3Q8IX90 412 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 NRMQ8IXM6 262 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 CDK20Q8IZL9 346 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC18Q8N456 261 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF148Q8N7C7 305 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 NUP37Q8NFH4 326 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ASB10Q8WXI3 467 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 MCHR2Q969V1 340 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SYT3Q9BQG1 590 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 TPK1Q9H3S4 243 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM38BQ9NVV0 291 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 A4GNTQ9UNA3 340 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 SPEF1Q9Y4P9 236 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PPW3 197 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP8B1O43520 1251 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms