RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MAPK14	Q16539	360 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ATF6B	Q99941	703 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF121	Q9H920	327 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		V9GYH0	126 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A087WWL8	130 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PQD3	144 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		J3QLW9	94 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMD9	O00233	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	WWP2	O00308	870 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PEX12	O00623	359 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CTDSPL	O15194	276 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FLRT2	O43155	660 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF264	O43296	627 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LYRM1	O43325	122 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FRS3	O43559	492 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2T1	O43869	369 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RDH16	O75452	317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR7A10	O76100	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GLCE	O94923	617 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	UBL3	O95164	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NTN1	O95631	604 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNDC12	O95881	172 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	REN	P00797	406 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	STATH	P02808	62 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	THY1	P04216	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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