RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ACVR1BP36896 505 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT6P53370 316 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PIGFQ07326 219 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ST3GAL3Q11203 375 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZP4Q12836 540 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TNK1Q13470 666 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 MED21Q13503 144 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 MELKQ14680 651 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 MDP1Q86V88 176 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OR6X1Q8NH79 312 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PFN4Q8NHR9 129 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 HTRA1Q92743 480 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF566Q969W8 418 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 FAM162AQ96A26 154 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 BOD1Q96IK1 185 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ADA2Q9NZK5 511 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CR1P17927 2039 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GVG6 124 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RNF223E7ERA6 249 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 NME4O00746 187 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OR7A10O76100 309 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINA1P01009 418 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV4-39P01824 125 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-HP01893 362 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IFNW1P05000 195 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CECR9P0C854 216 aa7.24□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 IFI30P13284 250 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 B4GALT1P15291 398 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PRDX6P30041 224 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 GSK3BP49841 420 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 UGT2B15P54855 530 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CLRN1P58418 232 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PSME3P61289 254 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 NAAAQ02083 359 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 GSG1Q2KHT4 349 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IFI44LQ53G44 452 aa7.24□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 RRM2BQ7LG56 351 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.24□□□□□ -1.25
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PTPRM-214ENST00000583153 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 PRRC1Q96M27 445 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 FOXB1Q99853 325 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 NELFAQ9H3P2 528 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RNF121Q9H920 327 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 INIPQ9NRY2 104 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CA10Q9NS85 328 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 GLTPQ9NZD2 209 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RHCGQ9UBD6 479 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 J3KTA2 159 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 DHHO43323 396 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 RAB36O95755 333 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV3-15P01624 115 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 IGHG1P01857 330 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 HEXAP06865 529 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CELA3BP08861 270 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 QDPRP09417 244 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OR4A8P0C604 315 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SAGP10523 405 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 NCK1P16333 377 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CALCRP30988 508 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINF1P36955 418 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 AQP2P41181 271 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF84P51523 738 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-214ENST00000583153 CHN2P52757 468 aa7.23□□□□□ -1.25
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