RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF175Q9Y473 711 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-205ENST00000577827 XRCC3O43542 346 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 NDUFB6O95139 128 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 IFNA4P05014 189 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 AKR1C2P52895 323 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 C12orf10Q9HB07 376 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 NUMA1Q14980 2115 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 TPPPO94811 219 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 CLUP10909 449 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 PVRP15151 417 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 PSMB6P28072 239 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 P2RX1P51575 399 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 GSG1Q2KHT4 349 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 YIPF5Q969M3 257 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 TRIP11Q15643 1979 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 DOCK1Q14185 1865 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 H7C1C5 153 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 IFNA10P01566 189 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 OR4E1P0C645 316 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 NME2P22392 152 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SDHAP31040 664 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 LCN6P62502 163 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 MALLQ13021 153 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRM-205ENST00000577827 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 DIO2Q92813 273 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 EDAQ92838 391 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRM-205ENST00000577827 A0A0A6YYD5 115 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 GJE1A6NN92 205 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 PEX12O00623 359 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-205ENST00000577827 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-205ENST00000577827 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-205ENST00000577827 C7orf61Q8IZ16 206 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 GPR137CQ8N3F9 429 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-205ENST00000577827 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 KLHL13Q9P2N7 655 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 NTNG1Q9Y2I2 539 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-205ENST00000577827 ST3GAL2Q16842 350 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-205ENST00000577827 CPT2P23786 658 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 DCTDP32321 178 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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PTPRM-205ENST00000577827 ZNF266Q14584 549 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF79Q15937 498 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 OPN5Q6U736 354 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.51□□□□□ -0.89
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