RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 ZBED6P86452 979 aa3.05□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 CD226Q15762 336 aa3.05□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.05□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 TSPAN32Q96QS1 320 aa3.05□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.04□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 C11orf88Q6PI97 169 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 C6orf89Q6UWU4 347 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 NUDT13Q86X67 352 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.04□□□□□ -1.92
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