RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529998.5

UBASH3B-205, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-205ENST00000529998 H7C1C5 153 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ARHGEF9O43307 516 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 DHHO43323 396 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 TIPRLO75663 272 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CCNB2O95067 398 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC2A10O95528 541 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 B4GALT1P15291 398 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 IFNGR2P38484 337 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 LCN6P62502 163 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 FMODQ06828 376 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 TSPAN31Q12999 210 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 MICAQ29983 383 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 RFX4Q33E94 735 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF627Q7L945 461 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 LINC00471Q8N535 108 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 HTRA1Q92743 480 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 RASD2Q96D21 266 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SAMD8Q96LT4 415 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 FOXB1Q99853 325 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 OR52D1Q9H346 318 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 NTN4Q9HB63 628 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 AKAP6Q13023 2319 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 NOTCH2Q04721 2471 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SPG11Q96JI7 2443 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 DSCAMO60469 2012 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ROS1P08922 2347 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 MAST4O15021 2626 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 A6NIZ1 184 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 M0R1B8 84 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SOCS2O14508 198 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 GNGT2O14610 69 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ABCD4O14678 606 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 IMPA2O14732 288 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PPP1R3DO95685 299 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 WNT11O96014 354 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 HLA-HP01893 362 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CD3EP07766 207 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PATE4P0C8F1 98 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CD40P25942 277 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 HOXC12P31275 282 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 NR1H2P55055 460 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 RAP1BP61224 184 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 RAP1AP62834 184 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PIGFQ07326 219 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SPOCK1Q08629 439 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 CD47Q08722 323 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 MESTQ5EB52 335 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 C10orf128Q5T292 105 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SSX8Q7RTT4 187 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SKA3Q8IX90 412 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 FANK1Q8TC84 345 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 GIPC3Q8TF64 312 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 NSMAFQ92636 917 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 NEUROG1Q92886 237 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF570Q96NI8 536 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 FEVQ99581 238 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 SH3GL3Q99963 347 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ALG12Q9BV10 488 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 YY1AP1Q9H869 796 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 NOX3Q9HBY0 568 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 B3GNT2Q9NY97 397 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-205ENST00000529998 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms