RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 AQP4P55087 323 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 CLDN17P56750 224 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 RAP1BP61224 184 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 RAP1AP62834 184 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 MESTQ5EB52 335 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ADCK1Q86TW2 530 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 IQCF1Q8N6M8 205 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 Q96M85 177 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ZNF570Q96NI8 536 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 OR2M2Q96R28 347 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 KCNK17Q96T54 332 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 SLC35F4A4IF30 521 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 HSPB2A8KAH6 182 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 AHCYL1O43865 530 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 SERPINI2O75830 405 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 IL18BPO95998 194 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 HMGN1P05114 100 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 BIDP55957 195 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 EFNB1P98172 346 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 FOXF2Q12947 444 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 KEAP1Q14145 624 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 MELKQ14680 651 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 HSPB2Q16082 182 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 HIST3H3Q16695 136 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 WFDC11Q8NEX6 87 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 DDOQ99489 341 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 CMC2Q9NRP2 79 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 A0A0G2JNJ9 132 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 H0YAE9 185 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 CGAP01215 116 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 PGA4P0DJD7 388 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 PGA3P0DJD8 388 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ACADSP16219 412 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 CTSSP25774 331 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 GGT2P36268 569 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ACVR1BP36896 505 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 OR3A2P47893 321 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 HSPA13P48723 471 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 MYBPC1Q00872 1141 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 PMPCAQ10713 525 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 TTC23Q5W5X9 447 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 AAED1Q7RTV5 226 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 TMEM54Q969K7 222 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 RASD2Q96D21 266 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 LRR1Q96L50 414 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ALG12Q9BV10 488 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ADI1Q9BV57 179 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 Q9UFV3 132 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 ZANQ9Y493 2812 aa14.85□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 SURF4O15260 269 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 SLC43A1O75387 559 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 IGHG1P01857 330 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 CD8BP10966 210 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 SELENOPP49908 381 aa14.84□□□□□ -0.03
PACS1-208ENST00000529677 RUNX1T1Q06455 604 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms