RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522995.1

CEP170-223, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 3

Gene CEP170, Length 608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-223	ENST00000522995	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	MCHR2	Q969V1	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	FOXB1	Q99853	325 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	TRIM15	Q9C019	465 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	TNFRSF11B	O00300	401 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	HS3ST1	O14792	307 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	DHH	O43323	396 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	ATP5H	O75947	161 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	KRT36	O76013	467 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	B4GALT1	P15291	398 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	MAGEA2	P43356	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	HMGA2	P52926	109 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	PIGF	Q07326	219 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	TAF11	Q15544	211 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	HIST3H3	Q16695	136 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	CHID1	Q9BWS9	393 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	POMP	Q9Y244	141 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	NDUFB2	O95178	105 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	HLA-H	P01893	362 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	RAP2A	P10114	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CD79A	P11912	226 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	IFNGR2	P38484	337 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ERF	P50548	548 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CD47	Q08722	323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	FLOT2	Q14254	428 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF627	Q7L945	461 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF611	Q8N823	705 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	HTRA1	Q92743	480 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	RADIL	Q96JH8	1075 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	DHRS12	A0PJE2	317 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CENPBD1	B2RD01	187 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ARHGEF9	O43307	516 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SLC2A10	O95528	541 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	IGHM	P01871	453 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CD14	P08571	375 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	PATE4	P0C8F1	98 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CBR1	P16152	277 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF84	P51523	738 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	FMOD	Q06828	376 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	MDP1	Q86V88	176 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SKA3	Q8IX90	412 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	NSMAF	Q92636	917 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995		Q96M85	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	RBP7	Q96R05	134 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CCL19	Q99731	98 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SMR3A	Q99954	134 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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