RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 NANSQ9NR45 359 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 UBQLN4Q9NRR5 601 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CEP250Q9BV73 2442 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 B4E171 279 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SOCS6O14544 535 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 EFSO43281 561 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 EMDP50402 254 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 RAB2AP61019 212 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 DEFA5Q01523 94 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 NHLH2Q02577 135 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TATDN3Q17R31 274 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 GUSBP11Q6P575 273 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC190Q86UF4 302 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 MISP3Q96FF7 219 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 RHOVQ96L33 236 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ15Q99712 375 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGDIGQ99819 225 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SERINC4A6NH21 518 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SHISA7A6NL88 538 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CDC42EP2O14613 210 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 FABP7O15540 132 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SLC2A1P11166 492 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TGM4P49221 684 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 WNT4P56705 351 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 STARD6P59095 220 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PLET1Q6UQ28 207 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A45Q8N413 288 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 MORN4Q8NDC4 146 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 OR1L3Q8NH93 324 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 KCTD7Q96MP8 289 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 STUB1Q9UNE7 303 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0U1RQV5 110 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GX78 115 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 C5orf52A6NGY3 159 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 H0YIG0 161 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 H3BSH0 61 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 H7C1Q1 480 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 LGALS8O00214 317 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SCRG1O75711 98 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 NKX2-2O95096 273 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 GOSR1O95249 250 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SLC34A2O95436 690 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 EPPINO95925 133 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 C4BPBP20851 252 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 GRPRP30550 384 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SDHAP31040 664 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 WDR73Q6P4I2 378 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 BCORP1Q8N888 145 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 OR52I1Q8NGK6 324 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 CEP76Q8TAP6 659 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-208ENST00000519076 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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