RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMIM30A4D0T7 59 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C9JVG2 144 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 G3V4G9 280 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZSCAN12O43309 604 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCG2P13521 617 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COX5AP20674 150 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CASP14P31944 242 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTGFRP43088 359 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBP5P82980 135 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C2orf54Q08AI8 447 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VGLL4Q14135 290 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF410Q86VK4 478 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM17Q86X19 198 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EGFL6Q8IUX8 553 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM256Q8N2U0 113 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CATSPER1Q8NEC5 780 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR5AU1Q8NGC0 362 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR6N1Q8NGY5 312 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR119Q8TDV5 335 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CENPOQ9BU64 300 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C15orf65H3BRN8 121 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGLV3-25P01717 112 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC130P13994 396 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NTF3P20783 257 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EPS15P42566 896 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAGEA6P43360 314 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCR8P51685 355 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRPSAP1Q14558 356 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PON2Q15165 354 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF141Q15928 474 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD22Q5VYY1 191 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RABEPKQ7Z6M1 372 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LPCAT1Q8NF37 534 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR5L2Q8NGL0 311 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NANPQ8TBE9 248 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NCLNQ969V3 563 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBCDQ9BTW9 1192 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A2Q9BXI2 301 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXO8Q9NRD0 319 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C8orf17Q9NRJ1 99 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SSH2Q76I76 1423 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FLNCQ14315 2725 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TECTAO75443 2155 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 D6RAR5 112 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NAPSAO96009 420 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CA1P00915 261 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR8U9P0C7N5 309 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC35G6P0C7Q6 338 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV1-13P0DP09 117 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATF6P18850 670 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LOXP28300 417 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GCAP28676 217 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARFIP1P53367 373 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCL23P55773 120 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NME5P56597 212 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNFRSF17Q02223 184 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RGNQ15493 299 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC15A2Q16348 729 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TEX30Q5JUR7 227 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MISPQ8IVT2 679 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRSS58Q8IYP2 241 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FIBINQ8TAL6 211 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DTD2Q96FN9 168 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VSTM2LQ96N03 204 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AP1M1Q9BXS5 423 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TTTY12Q9BZ98 90 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHOJQ9H4E5 214 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FN3KRPQ9HA64 309 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C21orf62Q9NYP8 219 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCPQ6ZWJ8 1503 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMA7O14818 248 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RS1O15537 224 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBCAO75347 108 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB36O95755 333 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACOT2P49753 483 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AP1B1Q10567 949 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BFSP1Q12934 665 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNX1Q13596 522 aa-0.74□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms