RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516663.1

RNU6-521P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 521, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-521P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 CFAP161Q6P656 301 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ARL9Q6T311 187 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 WASH2PQ6VEQ5 465 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 HDDC2Q7Z4H3 204 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 LEMD2Q8NC56 503 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 LINC00574Q9H8X3 128 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ANKEF1Q9NU02 776 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 AIPL1Q9NZN9 384 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 DLG5Q8TDM6 1919 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 FRMPD4Q14CM0 1322 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 SSH2Q76I76 1423 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 TRDCB7Z8K6 153 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 LY6LH3BQJ8 138 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 PSMA7O14818 248 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 RS1O15537 224 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 SLC7A4O43246 635 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 RAB3DO95716 219 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 RAB36O95755 333 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 OPN1LWP04000 364 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 IGF1P05019 195 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 IGKV1-13P0DP09 117 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 AK4P27144 223 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 CEACAM6P40199 344 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 STX1BP61266 288 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ERVK-25P63136 954 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 CTAG1AP78358 180 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 TNFRSF17Q02223 184 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ST3GAL4Q11206 333 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 MAB21L1Q13394 359 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 OR2G6Q5TZ20 316 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 KCTD16Q68DU8 428 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 DLEU7Q6UYE1 221 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 LINC00696Q6ZRV3 163 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 TMEM179Q6ZVK1 233 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 UTS2BQ765I0 119 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 KCTD9Q7L273 389 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 TMEM17Q86X19 198 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 EGFL6Q8IUX8 553 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 SDR42E1Q8WUS8 393 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 OR2V2Q96R30 315 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 TIMM17AQ99595 171 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 SLC6A7Q99884 636 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 RSG1Q9BU20 258 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 OSBPL10Q9BXB5 764 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 GBA3Q9H227 469 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 DSN1Q9H410 356 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF286AQ9HBT8 521 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 MCCC2Q9HCC0 563 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF302Q9NR11 478 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 FAM49BQ9NUQ9 324 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 CNIH4Q9P003 139 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 STX8Q9UNK0 236 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 LIPT1Q9Y234 373 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 RNF222A6NCQ9 220 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 G3V4G9 280 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 PSCAO43653 123 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 CREB3O43889 395 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ADGRB3O60242 1522 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 B3GAT3O94766 335 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 FN1P02751 2386 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 CT62P0C5K7 136 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 PCMT1P22061 227 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 GCAP28676 217 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 SSTR5P35346 364 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ADRA1AP35348 466 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 PTGFRP43088 359 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 RAD52P43351 418 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 LGALS7P47929 136 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 PKNOX1P55347 436 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 AP1B1Q10567 949 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 CHRNA6Q15825 494 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ORMDL2Q53FV1 153 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 MPV17L2Q567V2 206 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ANKRD22Q5VYY1 191 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 CNIH2Q6PI25 160 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 SPATA8Q6RVD6 105 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ASCL5Q7RTU5 278 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 PEX26Q7Z412 305 aa-0.51□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.4 ms