RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CRHR1	P34998	444 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MMP15	P51511	669 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	UCP2	P55851	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PAX2	Q02962	417 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	EGR4	Q05215	589 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	GNA13	Q14344	377 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SYPL1	Q16563	259 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ESCO2	Q56NI9	601 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SPRN	Q5BIV9	151 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	IL23R	Q5VWK5	629 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ANKFN1	Q8N957	763 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM233	B4DJY2	109 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276		H0YL77	283 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276		M0R082	166 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	HMGN4	O00479	90 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	COPE	O14579	308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	AIM2	O14862	343 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TGDS	O95455	350 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PROC	P04070	461 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MELTF	P08582	738 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	HLA-DOB	P13765	273 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	UQCRC2	P22695	453 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CCT5	P48643	541 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	COPZ1	P61923	177 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PMS2P3	Q13401	168 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	DYRK2	Q92630	601 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MECR	Q9BV79	373 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM120B	A0PK00	339 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CDHR4	A6H8M9	788 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	FZD7	O75084	574 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MFN2	O95140	757 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SNAP29	O95721	258 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PRG2	P13727	222 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	UEVLD	Q8IX04	471 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MIER2	Q8N344	545 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TXNDC15	Q96J42	360 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	PLSCR5	A0PG75	271 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	MS4A18	H0YCH9	400 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	GPR137B	O60478	399 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	HPR	P00739	348 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	C1QC	P02747	245 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	ADH4	P08319	380 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	CBL	P22681	906 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	GRPR	P30550	384 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	ARRB2	P32121	409 aa		11.08	□□□□□ -0.64
FAM53C-208	ENST00000511276	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		11.08	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms