RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MDP1	Q86V88	176 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CCDC115	Q96NT0	180 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PANX1	Q96RD7	426 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	DOK1	Q99704	481 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965		A8MVM7	634 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	KCNAB3	O43448	404 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NPIPB7	O75200	414 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NCR1	O76036	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF432	O94892	652 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	HLA-H	P01893	362 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	NUDT17	P0C025	328 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	UQCRB	P14927	111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CBL	P22681	906 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	S100A3	P33764	101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CAPZA2	P47755	286 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ACTG1	P63261	375 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	EGR4	Q05215	589 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF786	Q8N393	782 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	OR2M2	Q96R28	347 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965		M0R3G1	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SDHD	O14521	159 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	AHSA1	O95433	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	HPR	P00739	348 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	SERPINE1	P05121	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-210	ENST00000507965	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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