RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 ULK3Q6PHR2 472 aa17.71■□□□□ 0.43
NELFE-210ENST00000491139 PXKQ7Z7A4 578 aa17.71■□□□□ 0.43
NELFE-210ENST00000491139 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
NELFE-210ENST00000491139 DUX5Q96PT3 197 aa17.71■□□□□ 0.43
NELFE-210ENST00000491139 GAL3ST1Q99999 423 aa17.71■□□□□ 0.43
NELFE-210ENST00000491139 OR51B6Q9H340 312 aa17.71■□□□□ 0.43
NELFE-210ENST00000491139 SAP30LQ9HAJ7 183 aa17.71■□□□□ 0.43
NELFE-210ENST00000491139 BCL2L10Q9HD36 194 aa17.71■□□□□ 0.43
NELFE-210ENST00000491139 CACNG2Q9Y698 323 aa17.71■□□□□ 0.43
NELFE-210ENST00000491139 A0A0G2JK05 382 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 TRPC5OSA6NMA1 111 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 SERPINI2O75830 405 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 SASH3O75995 380 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 OR8G3PP0DMU2 310 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 CCL2P13500 99 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 AHCYP23526 432 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ERVS71-1P61550 626 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 LCN2P80188 198 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 FAM91A1Q658Y4 838 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 DOK3Q7L591 496 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 SLC22A24Q8N4F4 322 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 BBS10Q8TAM1 723 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 LRRC58Q96CX6 371 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 SLC47A1Q96FL8 570 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 C7orf26Q96N11 449 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 PNPOQ9NVS9 261 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 SELENONQ9NZV5 590 aa17.7■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 SDHDO14521 159 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 BGLAPP02818 100 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 DRD4P21917 467 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 TSTQ16762 297 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 GTDC1Q4AE62 458 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 C10orf53Q8N6V4 93 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ICA1LQ8NDH6 482 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 VPS33AQ96AX1 596 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ELMOD3Q96FG2 381 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 GPA33Q99795 319 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 BCL2L14Q9BZR8 327 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 C1orf198Q9H425 327 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 RMND5AQ9H871 391 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 RNF121Q9H920 327 aa17.69■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 POM121CA8CG34 1229 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 PLPP3O14495 311 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 SLC22A3O75751 556 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 FARS2O95363 451 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 NUDT7P0C024 238 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 PRKAR1BP31321 381 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 UCP2P55851 309 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 BIDP55957 195 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 IL13RA1P78552 427 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 TBC1D28Q2M2D7 210 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 TUSC1Q2TAM9 212 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 TMEM53Q6P2H8 277 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 WDR88Q6ZMY6 472 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 OR1J2Q8NGS2 313 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 CCL17Q92583 94 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 MAL2Q969L2 176 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ITCHQ96J02 903 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 MOGAT1Q96PD6 335 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 SH3GL3Q99963 347 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 LRMDAQ9H2I8 198 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 A4GALTQ9NPC4 353 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 UBAP1Q9NZ09 502 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 GLTPQ9NZD2 209 aa17.68■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 PPIAL4EA0A075B759 164 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ISPDA4D126 451 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 C5orf58C9J3I9 102 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 PPIAL4DF5H284 164 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 SNAP29O95721 258 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 PTHP01270 115 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 PPIAL4FP0DN26 164 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ETS2P15036 469 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ATP4BP51164 291 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 NCALDP61601 193 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 GLO1Q04760 184 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 BAMBIQ13145 260 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 RGNQ15493 299 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ARMCX4Q5H9R4 360 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 DPPA2Q7Z7J5 298 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ST7LQ8TDW4 575 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 TMEM54Q969K7 222 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 TMEM27Q9HBJ8 222 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 TCF7L2Q9NQB0 619 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 TMEM38BQ9NVV0 291 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 NUP50Q9UKX7 468 aa17.67■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 WNK1Q9H4A3 2382 aa17.66■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 LRRN3E7EW58 273 aa17.66■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 FOXH1O75593 365 aa17.66■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ADORA3P0DMS8 318 aa17.66■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 MAKP20794 623 aa17.66■□□□□ 0.42
NELFE-210ENST00000491139 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms