RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 HPP00738 406 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 F10P00742 488 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 ASAH2BP0C7U1 165 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 SLC16A1P53985 500 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 FCN2Q15485 313 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 PLA1AQ53H76 456 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 ESCO2Q56NI9 601 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 OR8H1Q8NGG4 311 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 RFT1Q96AA3 541 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 C12orf10Q9HB07 376 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 CHRNA9Q9UGM1 479 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 J3QRE1 110 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 TP53I11O14683 189 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 OPN1LWP04000 364 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 IL11P20809 199 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 FOXF1Q12946 379 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 BCL2L15Q5TBC7 163 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 MDGA2Q7Z553 956 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 DTX3Q8N9I9 347 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 WDSUB1Q8N9V3 476 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 RASD2Q96D21 266 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 GPR87Q9BY21 358 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 MED28Q9H204 178 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 TFPIP10646 304 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 ICAM2P13598 275 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB37Q5TC79 503 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 HBMQ6B0K9 141 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 TMEM234Q8WY98 164 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 NKD1Q969G9 470 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 ALG8Q9BVK2 526 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 ABCG5Q9H222 651 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 FN3KQ9H479 309 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 CYSLTR2Q9NS75 346 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 HPF1Q9NWY4 346 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 C21orf140B9A014 251 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 BGLAPP02818 100 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 TIGD4Q8IY51 512 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 MAP6Q96JE9 813 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 ARL5BQ96KC2 179 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 TRIM36Q9NQ86 728 aa15.59■□□□□ 0.09
PRRT4-205ENST00000489835 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 C11orf98E9PRG8 122 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 EFNA2O43921 213 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 HIST1H2ABP04908 130 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 CTXN1P60606 82 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 ALG10Q5BKT4 473 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 C1orf140Q5VVS0 124 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 OR2M3Q8NG83 312 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 ZPLD1Q8TCW7 415 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 HIST1H2ACQ93077 130 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 Q96M85 177 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 GPR137Q96N19 417 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 NMNAT3Q96T66 252 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 PROK2Q9HC23 129 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 ING4Q9UNL4 249 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.58■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 TRAV6A0A075B6T7 132 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 DAPL1A0PJW8 107 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 A8MVM7 634 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 H3BML4 177 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF3P17036 446 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 BTCP35070 178 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 PER3P56645 1201 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 PRPS1P60891 318 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 NIPAL3Q6P499 406 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 ASCL5Q7RTU5 278 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 SAMD12Q8N8I0 201 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 LIPHQ8WWY8 451 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 ST8SIA1Q92185 356 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 GNRHR2Q96P88 292 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRT4-205ENST00000489835 CACNG2Q9Y698 323 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms