RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NKD1Q969G9 470 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NANSQ9NR45 359 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 DUXAA6NLW8 204 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ARPC5O15511 151 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 FOXS1O43638 330 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 FMO6PO60774 539 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 DIRAS3O95661 229 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HLA-DPB1P04440 258 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ITGB2P05107 769 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ANXA5P08758 320 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 EBLN1P0CF75 366 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NFYBP25208 207 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SHC1P29353 583 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MPGP29372 298 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CMPK1P30085 196 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MAP3K8P41279 467 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GAS1P54826 345 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PLA2G7Q13093 441 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 DYRK1AQ13627 763 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 IFI44LQ53G44 452 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HBMQ6B0K9 141 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TMEM205Q6UW68 189 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 FAM122BQ7Z309 247 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 AMER3Q8N944 861 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 COL26A1Q96A83 441 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TEAD3Q99594 435 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NRTNQ99748 197 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CMKLR1Q99788 373 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 IFT27Q9BW83 186 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 IPPKQ9H8X2 491 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 BEX1Q9HBH7 125 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 LRIT2A6NDA9 550 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GABRPO00591 440 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR2T1O43869 369 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ITGA10O75578 1167 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 IGF2P01344 180 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 IFNA2P01563 188 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PRPS2P11908 318 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OSMP13725 252 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PAX6P26367 422 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PCGF2P35227 344 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ADH7P40394 386 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MMP15P51511 669 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.97□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 OR4E1P0C645 316 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 IFNGR1P15260 489 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TNFRSF1BP20333 461 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 GALP22466 123 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 BCL6P41182 706 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 XCR1P46094 333 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 RAB8AP61006 207 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 IDNKQ5T6J7 187 aa6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
USP4-211ENST00000485450 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.96□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms