RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470143.1

NOP56-210, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-210ENST00000470143 PTHP01270 115 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 TSPAN19P0C672 248 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 LYNX1P0DP58 116 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 COL8A2P25067 703 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 PCGF2P35227 344 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 RETREG3Q86VR2 466 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 LRP11Q86VZ4 500 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 OR4D11Q8NGI4 311 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 FGFBP3Q8TAT2 258 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 ZFAND2BQ8WV99 257 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 LIPHQ8WWY8 451 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SYT3Q9BQG1 590 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 GPR160Q9UJ42 338 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.49□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 ANGPT2O15123 496 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 RNF13O43567 381 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 RP2O75695 350 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SERPINI2O75830 405 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 BCL10O95999 233 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 IGHG1P01857 330 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 HIST1H2ABP04908 130 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SRP14P37108 136 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 RBM34P42696 430 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 ALDH3B1P43353 468 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 GZMMP51124 257 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SEC24CP53992 1094 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MTPNP58546 118 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SELENOVP59797 346 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SELPLGQ14242 412 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 PCGF3Q3KNV8 242 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SLC36A2Q495M3 483 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 TMEM53Q6P2H8 277 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 HDDC2Q7Z4H3 204 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 OR1J2Q8NGS2 313 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 ZNF519Q8TB69 540 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 HIST1H2ACQ93077 130 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 TAMM41Q96BW9 452 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SIKE1Q9BRV8 207 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SLC7A7Q9UM01 511 aa11.48□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 C17orf100A8MU93 164 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MT-ND1P03886 318 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 OPN1SWP03999 348 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MSMBP08118 114 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 QDPRP09417 244 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 PATE4P0C8F1 98 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SAGP10523 405 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 RAD52P43351 418 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 CRYBA2P53672 197 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 LMO4P61968 165 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SCGB2A2Q13296 93 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MOGQ16653 247 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 VMACQ2NL98 169 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 C10orf128Q5T292 105 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 TEX29Q8N6K0 151 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SYNPRQ8TBG9 265 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 DYDC1Q8WWB3 177 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 YIPF5Q969M3 257 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MCHR2Q969V1 340 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 TMEM186Q96B77 213 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MAGEB18Q96M61 343 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SH3GL3Q99963 347 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 SMURF2Q9HAU4 748 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 DUSP13Q9UII6 198 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 METRNQ9UJH8 293 aa11.47□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 A0A1W2PPW3 197 aa11.46□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 NCR1O76036 304 aa11.46□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 NPPAP01160 153 aa11.46□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 GAAP10253 952 aa11.46□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 THRBP10828 461 aa11.46□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 NAT2P11245 290 aa11.46□□□□□ -0.57
NOP56-210ENST00000470143 ANPEPP15144 967 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms