RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449489.5

RBM39-218, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 5

Gene RBM39, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-218ENST00000449489 TM9SF1O15321 606 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 DHHO43323 396 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 AKAP10O43572 662 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 PIP5K1CO60331 668 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 NPIPB7O75200 414 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 UBL3O95164 117 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CLPTM1O96005 669 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 IGHV2-70P01814 119 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 TFPTP0C1Z6 253 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CD79AP11912 226 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 UQCRBP14927 111 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ZNF43P17038 809 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 MATN1P21941 496 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 LIPAP38571 399 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CAPZA2P47755 286 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 RAB1AP62820 205 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 SNX32Q86XE0 403 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 DDIASQ8IXT1 998 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 COQ8BQ96D53 544 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 TSSK3Q96PN8 268 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 MECRQ9BV79 373 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 C1orf198Q9H425 327 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 WDR45Q9Y484 360 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 NPTNQ9Y639 398 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CACNG2Q9Y698 323 aa6.13□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ISPDA4D126 451 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 XPNPEP2O43895 674 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 SCN2BO60939 215 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 SNAP29O95721 258 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 RAB36O95755 333 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CD55P08174 381 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 MELTFP08582 738 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 UROSP10746 265 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 NEFHP12036 1026 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CXCR1P25024 350 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CRHR1P34998 444 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 PHBP35232 272 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 HPCAL1P37235 193 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ZNF81P51508 661 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 MMP15P51511 669 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CLDN17P56750 224 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CAMK2DQ13557 499 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 RNF130Q86XS8 419 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 TMEM123Q8N131 208 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 SLC35F6Q8N357 371 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 KIF18AQ8NI77 898 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ZG16BQ96DA0 208 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CCDC126Q96EE4 140 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 OXGR1Q96P68 337 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.11□□□□□ -1.43
RBM39-218ENST00000449489 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms