RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP2CBP62714 309 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP2CAP67775 309 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PMS2P11Q13670 270 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MED27Q6P2C8 311 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8S1Q8NH09 359 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NEU1Q99519 415 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TEAD3Q99594 435 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 POFUT1Q9H488 388 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOFQ9HBH0 211 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MYNNQ9NPC7 610 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CA14Q9ULX7 337 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SULT2B1O00204 365 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MBTPS2O43462 519 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R3DO95685 299 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 STAG3L3P0CL85 134 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CD79AP11912 226 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NR2C1P13056 603 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB5AP20339 215 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SGSHP51688 502 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PNLIPRP1P54315 467 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R43P59537 309 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF85Q03923 595 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 HGFACQ04756 655 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP19Q14CB8 494 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GAREM2Q75VX8 874 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GID4Q8IVV7 300 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO32Q969P5 355 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GFI1Q99684 422 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MED17Q9NVC6 651 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 IFITM5A6NNB3 132 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CBR3O75828 277 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHEP01854 428 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GYPBP06028 91 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 LIPCP11150 499 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF2F2P13984 249 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ST6GAL1P15907 406 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FUT1P19526 365 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PAX6P26367 422 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A2P29034 98 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PDHA2P29803 388 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DDTP30046 118 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGER1P34995 402 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM189A2Q15884 450 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6N1Q8NGY5 312 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF141Q8WVD5 230 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC39A7Q92504 469 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG14Q96F25 216 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TGM7Q96PF1 710 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NOX4Q9NPH5 578 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 IL19Q9UHD0 177 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 IFITM10A6NMD0 228 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TGM5O43548 720 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CD160O95971 181 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CD8AP01732 235 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PMP2P02689 132 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MYOGP15173 224 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NME2P22392 152 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CD80P33681 288 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKN3Q16667 212 aa7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms