RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBA1AQ71U36 451 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF627Q7L945 461 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LINC00471Q8N535 108 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2T29Q8NH02 315 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FANK1Q8TC84 345 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FNDC8Q8TC99 324 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MCHR2Q969V1 340 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPAN32Q96QS1 320 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALG12Q9BV10 488 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHID1Q9BWS9 393 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRMDAQ9H2I8 198 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRHPRQ9UBQ7 328 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC7A8Q9UHI5 535 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATE1O95260 518 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IST1P53990 364 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVK-25P63136 954 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYBPC1Q00872 1141 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF519Q8TB69 540 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CANT1Q8WVQ1 401 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXW5Q969U6 566 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPA33Q99795 319 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMURF2Q9HAU4 748 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM38BQ9NVV0 291 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POU2F3Q9UKI9 436 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZFHX3Q15911 3703 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XKRYO14609 159 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTP4A3O75365 173 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCNB2O95067 398 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FARS2O95363 451 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD79AP11912 226 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDH11P55287 796 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GK3PQ14409 553 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C3orf36Q3SXR2 165 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGBD2Q6P3X8 592 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC22A25Q6T423 547 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC121Q6ZUS5 278 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF611Q8N823 705 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF570Q96NI8 536 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC38A2Q96QD8 506 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBP7Q96R05 134 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNK17Q96T54 332 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCL19Q99731 98 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNS3Q9BQ31 491 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YY1AP1Q9H869 796 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MED13LQ71F56 2210 aa15.15■□□□□ 0.02
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHISA9B4DS77 424 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC2A10O95528 541 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CST1P01037 141 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HLA-HP01893 362 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CBR1P16152 277 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD53P19397 219 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SDHAP31040 664 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARR3P36575 388 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GSSP48637 474 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPOCK1Q08629 439 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPAN31Q12999 210 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GSG1Q2KHT4 349 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRN1LQ496H8 165 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 THEM4Q5T1C6 240 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C10orf128Q5T292 105 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR139Q6DWJ6 353 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 THSD4Q6ZMP0 1018 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM122BQ7Z309 247 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC22A24Q8N4F4 322 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR9Q2Q8NGE9 314 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIGTQ969N2 578 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MBD6Q96DN6 1003 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR52D1Q9H346 318 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL20RAQ9UHF4 553 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 U3KQV3 271 aa15.14■□□□□ 0.01
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms