RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 NPTNQ9Y639 398 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GUS0 222 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SPAG7O75391 227 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINI2O75830 405 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SBK2P0C263 348 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CSNK1A1P48729 337 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 MMP15P51511 669 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CRISP3P54108 245 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SLC3A1Q07837 685 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 C5orf46Q6UWT4 87 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 OR1J1Q8NGS3 322 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 BCL2L14Q9BZR8 327 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 RNF121Q9H920 327 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 C12orf10Q9HB07 376 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SLC6A13Q9NSD5 602 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GWA3 101 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 FAM181BA6NEQ2 426 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TIMM23O14925 209 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ITM2AO43736 263 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SNAP29O95721 258 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV2-70P01814 119 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 BGLAPP02818 100 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 IL12AP29459 219 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SLC6A9P48067 706 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 UFM1P61960 85 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 RELBQ01201 579 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PMS2P3Q13401 168 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ASPHD2Q6ICH7 369 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PARP8Q8N3A8 854 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 MNS1Q8NEH6 495 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 OR52E2Q8NGJ4 325 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TCP10LQ8TDR4 215 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM54Q969K7 222 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM19Q96HH6 336 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0G2JPF8 293 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 LRRN3E7EW58 273 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 MFN2O95140 757 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 KRT75O95678 551 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 HTR2AP28223 471 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CD80P33681 288 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 MPV17P39210 176 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 CRATP43155 626 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 RAG2P55895 527 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 BIDP55957 195 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 DSTNP60981 165 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PAX8Q06710 450 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PUDPQ08623 228 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D28Q2M2D7 210 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF781Q8N8C0 355 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2FQ969M7 185 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 MOGAT1Q96PD6 335 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 OR52E6Q96RD3 313 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ASPNQ9BXN1 380 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TNFRSF19Q9NS68 423 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM38BQ9NVV0 291 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 GLTPQ9NZD2 209 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 IFT52Q9Y366 437 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 BPGMP07738 259 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 AHCYP23526 432 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 ALG10BQ5I7T1 473 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA46Q5T0L3 261 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 THEM4Q5T1C6 240 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 LRFN4Q6PJG9 635 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 LSMEM1Q8N8F7 131 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 SCAIQ8N9R8 606 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 OR1J2Q8NGS2 313 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 OR4F5Q8NH21 305 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 OR6S1Q8NH40 331 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 DIRC2Q96SL1 478 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf198Q9H425 327 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PPCSQ9HAB8 311 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 C1RLQ9NZP8 487 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 GPR45Q9Y5Y3 372 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 A8MXK9 166 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PLPP3O14495 311 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PLATP00750 562 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 LBPP18428 481 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 PXKQ7Z7A4 578 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD12-201ENST00000404162 OR4K5Q8NGD3 323 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms