RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 GABARAPL3Q9BY60 117 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SGK2Q9HBY8 427 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF639Q9UID6 485 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TMED5Q9Y3A6 229 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR62O43379 1518 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 LRP4O75096 1905 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SLIT3O75094 1523 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0U1RQS6 177 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PPE3 182 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PPV9 198 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM25EA8MYX2 175 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 HAS3O00219 553 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CCL21O00585 134 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf105O95561 183 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ETS2P15036 469 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 GDI1P31150 447 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 EPS15P42566 896 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP5OP48047 213 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CCR8P51685 355 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP2.24□□□□□ -2.055e-12■■□□□ 13.8
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC61GP60059 68 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 PPIL2Q13356 520 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CUL2Q13617 745 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00483Q53H64 154 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM71E1Q6IPT2 247 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM7AQ6ZMT4 941 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF695Q8IW36 515 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM86B1Q8N7N1 296 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OR8J1Q8NGP2 316 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2G2Q8NGZ5 317 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 HSFY1Q96LI6 401 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf42Q96LP6 360 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CFAP53Q96M91 514 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB18Q99592 522 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM59Q9BXS4 323 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 FN3KRPQ9HA64 309 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 NTN4Q9HB63 628 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC40A1Q9NP59 571 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 INPP5EQ9NRR6 644 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 NPTNQ9Y639 398 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 MYO10Q9HD67 2058 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CTAGE15A4D2H0 777 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 BTBD17A6NE02 478 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52A4PA6NMU1 304 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF726A6NNF4 738 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ERLIN2O94905 339 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 PMELP40967 661 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 UGT2B15P54855 530 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXW4P57775 412 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TMED1Q13445 227 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 GK3PQ14409 553 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP19Q14CB8 494 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZR03 302 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 STRADAQ7RTN6 431 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CTAGE6Q86UF2 777 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 LHFPL3Q86UP9 236 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 MREGQ8N565 214 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4F6Q8NGB9 312 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OR1L6Q8NGR2 347 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 IFT74Q96LB3 600 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 BMFQ96LC9 184 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TSSK3Q96PN8 268 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SH3GL1Q99961 368 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OSBPL10Q9BXB5 764 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CD84Q9UIB8 345 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 PEX16Q9Y5Y5 336 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TCP11X1B4DZS4 312 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 H0Y8G0 127 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 H0YHG0 523 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 KMOO15229 486 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP5-8O75690 187 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 C2P06681 752 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ASGR1P07306 291 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC7A9P82251 487 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF92Q03936 586 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 IFT88Q13099 833 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZMYND11Q15326 602 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2SQ16763 222 aa2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms