RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOLR1P15328 257 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRIA1P42261 906 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESRRGP62508 458 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 GINS1Q14691 196 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP157Q5JU67 520 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDZK1Q5T2W1 519 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATAD3BQ5T9A4 648 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENPP6Q6UWR7 440 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF493Q6ZR52 646 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 PEX26Q7Z412 305 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 VSTM4Q8IW00 320 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 LGI3Q8N145 548 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 STEAP2Q8NFT2 490 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESR2Q92731 530 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM4SF18Q96CE8 201 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED8Q96G25 268 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 COQ2Q96H96 371 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MS4A4EQ96PG1 132 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTMR9Q96QG7 549 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR8B4Q96RC9 309 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SORT1Q99523 831 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHPKQ9UHJ6 478 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSH6P52701 1360 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa1.54□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 GMFGO60234 142 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDN9O95484 217 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF1P05230 155 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 FABP3P05413 133 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 DBTP11182 482 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 AK4P27144 223 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 FDFT1P37268 417 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 YAP1P46937 504 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP1B3P54709 279 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDK3Q15120 406 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 PON3Q15166 354 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCTD21Q4G0X4 260 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF684Q5T5D7 378 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM179Q6ZVK1 233 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABHD13Q7L211 337 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR86Q86TI4 376 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRPV1Q8NER1 839 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSFY1Q96LI6 401 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 COPS8Q99627 209 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAIM2Q9BWQ8 316 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 C12orf10Q9HB07 376 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMG20AQ9NP66 347 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 ISYNA1Q9NPH2 558 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLE4Q9NR33 117 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1257Q9ULG3 409 aa1.53□□□□□ -2.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRWD3Q6RI45 1802 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR62O43379 1518 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF233A6NK53 670 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0YCG3 227 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA8SH3BPF8 625 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCMRO60667 390 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPAG6O75602 509 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV2-5P01817 119 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFNAR2P48551 515 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CX3CR1P49238 355 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCT3P49368 545 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 UGT2B15P54855 530 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGL1Q08830 312 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP19Q14CB8 494 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 POU2AF1Q16633 256 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC152Q4G0S7 254 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM78AQ5JUQ0 283 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALNT17Q6IS24 598 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP112Q8N8E3 955 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52M1Q8NGK5 317 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5D13Q8NGL4 314 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4S2Q8NH73 311 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSPH1Q8WYR4 309 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 L3HYPDHQ96EM0 354 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF157Q96PX1 679 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF382Q96SR6 550 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXC2Q99958 501 aa1.52□□□□□ -2.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH3GL3Q99963 347 aa1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms