RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP13Q9UII6 198 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM64BA6NI03 449 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GABARAPO95166 117 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MSL3P1P0C860 447 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SGCEO43556 437 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 POU2F2P09086 479 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP2K6P52564 334 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF681Q96N22 645 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GHRLQ9UBU3 117 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MSR1P21757 451 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 METAP1P53582 386 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SARAFQ96BY9 339 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GLTPQ9NZD2 209 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GNG12Q9UBI6 72 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP205Q92621 2012 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SELENOFO60613 162 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 APOC3P02656 99 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SDHAP31040 664 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FGGYQ96C11 551 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ALG14Q96F25 216 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MED16Q9Y2X0 877 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KNTC1P50748 2209 aa14.96□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFSF15O95150 251 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDOBP05062 364 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 LIPCP11150 499 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC9Q92623 222 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PSD2Q9BQI7 771 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 FRG2CA6NGY1 282 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ICOSLGO75144 302 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TEKQ02763 1124 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC10A1Q14973 349 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PRRG2O14669 202 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 NXPH2O95156 264 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ISL1P61371 349 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC14A1Q13336 389 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZTK2 550 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 NOXA1Q86UR1 476 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF254O75437 659 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ACHEP22303 614 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 GDNFP39905 211 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 BCL2A1Q16548 175 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ACKR1Q16570 336 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL11Q969Q4 196 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 IER2Q9BTL4 223 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 C12orf49Q9H741 205 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM82A0PJX8 343 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PAPLNO95428 1278 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6V1Q8N148 313 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 EMC6Q9BV81 110 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 BET1O15155 118 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 RFPL3O75679 317 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TATDN3Q17R31 274 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 LAX1Q8IWV1 398 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 FXYD1O00168 92 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 MBTPS2O43462 519 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 LIPNQ5VXI9 398 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SGK3Q96BR1 496 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 UPRTQ96BW1 309 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM100Q9NV29 134 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms