RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 BEST3Q8N1M1 668 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CEP19Q96LK0 163 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 RBP7Q96R05 134 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 RERGLQ9H628 205 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 OR2M5A3KFT3 312 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 TVP23AA6NH52 213 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CDRT15L2A8MXV6 281 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 SULT2B1O00204 365 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 LRRTM2O43300 516 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ABHD16AO95870 558 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CTLA4P16410 223 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CNR1P21554 472 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 H3F3AP84243 136 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 MXD1Q05195 221 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 THEM4Q5T1C6 240 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 KDM8Q8N371 416 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 SYT14Q8NB59 555 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 TPK1Q9H3S4 243 aa14.56□□□□□ -0.08
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HPS1-202ENST00000338546 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 PCSK5Q92824 1860 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ISPDA4D126 451 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 LINC01387J3KSC0 135 aa14.55□□□□□ -0.08
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HPS1-202ENST00000338546 ARL6IP5O75915 188 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 NR2C1P13056 603 aa14.55□□□□□ -0.08
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HPS1-202ENST00000338546 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.55□□□□□ -0.08
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HPS1-202ENST00000338546 RPTNQ6XPR3 784 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 OR6X1Q8NH79 312 aa14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
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HPS1-202ENST00000338546 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.55□□□□□ -0.08
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HPS1-202ENST00000338546 A0A1W2PNR3 127 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CTDSP2O14595 271 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 TMEM127O75204 238 aa14.54□□□□□ -0.08
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HPS1-202ENST00000338546 AQP8O94778 261 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ZNF432O94892 652 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 HLA-DQA2P01906 255 aa14.54□□□□□ -0.08
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HPS1-202ENST00000338546 TNFSF8P32971 234 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 FOXK1P85037 733 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 RGS21Q2M5E4 152 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 DDI2Q5TDH0 399 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 MZT2AQ6P582 158 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
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HPS1-202ENST00000338546 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 OR2B2Q9GZK3 357 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 LRFN1Q9P244 771 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.54□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.53□□□□□ -0.08
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