RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP82Q8N141 532 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC30A6NM36 301 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 CR2P20023 1033 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 M6PRP20645 277 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 NME2P22392 152 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF74Q16587 644 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 SPRED1Q7Z699 444 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 B3GAT1Q9P2W7 334 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF732B4DXR9 585 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 GABARAPH6UMI1 98 aa20.57■□□□□ 0.88
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PTPRM-201ENST00000332175 GABARAPO95166 117 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 HCCSP53701 268 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 GPR173Q9NS66 373 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.57■□□□□ 0.88
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PTPRM-201ENST00000332175 PYCR3Q53H96 274 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 KCNIP4Q6PIL6 250 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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PTPRM-201ENST00000332175 SMIM15Q7Z3B0 74 aa20.57■□□□□ 0.88
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PTPRM-201ENST00000332175 DEGS1O15121 323 aa20.57■□□□□ 0.88
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PTPRM-201ENST00000332175 ADPRMQ3LIE5 342 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 VWA2Q5GFL6 755 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 GDPD3Q7L5L3 318 aa20.57■□□□□ 0.88
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PTPRM-201ENST00000332175 TRIB1Q96RU8 372 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 BANF2Q9H503 90 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 OBP2AQ9NY56 170 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC2DQ9UHP7 191 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 ACSM1Q08AH1 577 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 WBP2Q969T9 261 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 POM121BA6NF01 834 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM240Q5SV17 173 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 Q96M85 177 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 RNF4P78317 190 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 CDONQ4KMG0 1287 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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PTPRM-201ENST00000332175 P2RX1P51575 399 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 TEKQ02763 1124 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 CMIPQ8IY22 773 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 HRH3Q9Y5N1 445 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 SPINT2O43291 252 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 CNIH1O95406 144 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 PRKACAP17612 351 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 S100A7P31151 101 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 RAB11AP62491 216 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP6Q16828 381 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 NAXDQ8IW45 347 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 GJC3Q8NFK1 279 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GVG6 124 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 AQP7O14520 342 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 FPR3P25089 353 aa20.55■□□□□ 0.88
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PTPRM-201ENST00000332175 CCR6P51684 374 aa20.55■□□□□ 0.88
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PTPRM-201ENST00000332175 FAM3DQ96BQ1 224 aa20.55■□□□□ 0.88
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PTPRM-201ENST00000332175 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 PAPLNO95428 1278 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 NAGAP17050 411 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 MTNR1BP49286 362 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 BCORP1Q8N888 145 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 LYRM4Q9HD34 91 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 MAP2K6P52564 334 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 GRB2P62993 217 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 UFSP2Q9NUQ7 469 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 SMLR1H3BR10 107 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 OR1N1Q8NGS0 311 aa20.54■□□□□ 0.88
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