RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284073.6

MSI2-201, Transcript of musashi RNA binding protein 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI2, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2-201ENST00000284073 RAB30Q15771 203 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 PFN4Q8NHR9 129 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 DRGXA6NNA5 263 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 ANGPTL7O43827 346 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 LPLP06858 475 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 CAMK2BQ13554 666 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 USP51Q70EK9 711 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 CREBZFQ9NS37 354 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 H0YIV9 168 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 MGMTP16455 207 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 SDHAP31040 664 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 LCN15Q6UWW0 184 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 BAP18Q8IXM2 172 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 PSMF1Q92530 271 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 FBXW5Q969U6 566 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 ZNF566Q969W8 418 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 OR5K4A6NMS3 321 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 QDPRP09417 244 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 COTL1Q14019 142 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 CST6Q15828 149 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 TEAD3Q99594 435 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 BANF2Q9H503 90 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 MOKQ9UQ07 419 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 Q9Y3F1 56 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 PI3P19957 117 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.59□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 DCTDP32321 178 aa14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 CUTCQ9NTM9 273 aa14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 RAB22AQ9UL26 194 aa14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 KIF1AQ12756 1690 aa14.58□□□□□ -0.07
MSI2-201ENST00000284073 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 PVRP15151 417 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ACKR3P25106 362 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 IL2RGP31785 369 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MEOX2P50222 304 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 CCDC190Q86UF4 302 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 CPXM2Q8N436 756 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 JTBO76095 146 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 XKR7Q5GH72 579 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 NEURL3Q96EH8 262 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ZNF727A8MUV8 499 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 RAB13P51153 203 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 TMEM18Q96B42 140 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 POMT2Q9UKY4 750 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 A0A1B0GWA3 101 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MELKQ14680 651 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.58□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 OR2A14Q96R47 310 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms