RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259607.6

CCL21-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 21, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL21, Length 852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21-201ENST00000259607 CD79AP11912 226 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 APEHP13798 732 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 CD53P19397 219 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 MAKP20794 623 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 FPR3P25089 353 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 MAGEA2P43356 314 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 GPR4P46093 362 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ARHGDIAP52565 204 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 HMGA2P52926 109 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 PCBD1P61457 104 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 PLP2Q04941 152 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 BNIP1Q12981 228 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 FLOT2Q14254 428 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 MELKQ14680 651 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 LAPTM4AQ15012 233 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ETFDHQ16134 617 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 HIST3H3Q16695 136 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 SHEQ5VZ18 495 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 DNM1P34Q6PK57 102 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 SMARCD3Q6STE5 483 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 OR52L1Q8NGH7 329 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 OR1J2Q8NGS2 313 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 OR52J3Q8NH60 311 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 MCHR2Q969V1 340 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 SEPHS2Q99611 448 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 DHRS9Q9BPW9 319 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 CXXC4Q9H2H0 198 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 FREM1Q5H8C1 2179 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ABCA4P78363 2273 aa9□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 DHRS12A0PJE2 317 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 GNGT2O14610 69 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 IMPA2O14732 288 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 IDH3BO43837 385 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 CCNB2O95067 398 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 PAX1P15863 534 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 GSTM3P21266 225 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ATP6V1B2P21281 511 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 SDHAP31040 664 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 SLC6A6P31641 620 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ACVR1BP36896 505 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 OMPP47874 163 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 GALK2Q01415 458 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 C10orf128Q5T292 105 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 LINGO2Q7L985 606 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 OR2T29Q8NH02 315 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 FANK1Q8TC84 345 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ZNF570Q96NI8 536 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 SIAEQ9HAT2 523 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 POLQO75417 2590 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 SPG11Q96JI7 2443 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 A0A1W2PR80 420 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 ACOT8O14734 319 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 CIB2O75838 187 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 DIRAS1O95057 198 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 CST1P01037 141 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 IGLV1-44P01699 117 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 B4GALT1P15291 398 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 NOS3P29474 1203 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 CRABP1P29762 137 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 LIMS1P48059 325 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 FABP6P51161 128 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL21-201ENST00000259607 RAB1AP62820 205 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms