RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 GPR85P60893 370 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 ACVR1Q04771 509 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 CD276Q5ZPR3 534 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 METRNLQ641Q3 311 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SSX9Q7RTT3 188 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MVB12AQ96EY5 273 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 MED30Q96HR3 178 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 IER2Q9BTL4 223 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BCO1Q9HAY6 547 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 RNF24Q9Y225 148 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.65□□□□□ -1.34
CPS1-201ENST00000233072 BHLHE40O14503 412 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DOK2O60496 412 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 F13BP05160 661 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 NID1P14543 1247 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GPX2P18283 190 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TACR1P25103 407 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 UBE2KP61086 200 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OR8B8Q15620 311 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ST8SIA1Q92185 356 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 A0A087WV62 115 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 XRCC2O43543 280 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 NXPH2O95156 264 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SCGB1D1O95968 90 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GYPBP06028 91 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 AVPI1Q5T686 147 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.65□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GV50 99 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TXNL1O43396 289 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TGOLN2O43493 480 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ABHD16AO95870 558 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SNCAP37840 140 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SELENBP1Q13228 472 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 C4orf17Q53FE4 359 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 THEM4Q5T1C6 240 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SLC51BQ86UW2 128 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GNG12Q9UBI6 72 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 OR2A25A4D2G3 310 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 IMPA2O14732 288 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 DSCR3O14972 297 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 YY2O15391 372 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 FOLR1P15328 257 aa6.64□□□□□ -1.35
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CPS1-201ENST00000233072 PSMB3P49720 205 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 HOXC5Q00444 222 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GAREM1Q9H706 876 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 ZNF749O43361 778 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 PRAMEF4O60810 478 aa6.64□□□□□ -1.35
CPS1-201ENST00000233072 GSK3AP49840 483 aa6.64□□□□□ -1.35
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