RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr584Q8VGW0 319 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc9a3r2Q9JHL1 337 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnase2bQ9QY48 354 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp345A2AQA1 561 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chrnb1P09690 501 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HfeP70387 359 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 St3gal3P97325 374 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mier2Q3U3N0 541 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clec4a4Q5YIR8 236 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm9758Q80ZT2 255 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr92Q8BGF3 357 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem255aQ8BHW5 351 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pno1Q9CPS7 248 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adck1Q9D0L4 525 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spry4Q9WTP2 300 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spag17Q5S003 2320 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr560A0A1B0GSU5 314 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r137D3YTY1 307 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r143E9PUW9 307 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mfsd4b5E9PYY6 479 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r157E9Q069 297 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r139E9Q8L6 297 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r112G3UY48 297 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3542K7N6U2 270 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r135K9J7G0 307 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r125L7N227 307 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r116L7N2A6 307 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cacng2O88602 323 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SnrpbP27048 231 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FshrP35378 692 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mapk14P47811 360 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Btg1P62325 171 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col10a1Q05306 680 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nxph1Q61200 271 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr429Q7TRW1 312 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem221Q8K071 230 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PhyhipQ8K0S0 330 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asb15Q8VHS6 583 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TipinQ91WA1 278 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r100Q9EPS5 307 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcb10Q9JI39 715 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sectm1bQ9JL59 212 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7929A0A286YDV3 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm9008E9PVG0 424 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr610E9Q598 315 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21977F6U3N7 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8247F6VRJ8 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8005F6YKY3 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3015F6ZAP6 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8212F6ZMY5 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7954F7BAX1 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8138F7BY56 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8232F7CFJ3 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17079F7D8Y4 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8165L7N218 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8122L7N2C7 213 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17078M0QW51 211 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01661 131 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01662 111 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01663 111 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PpibP24369 216 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P2rx1P51576 399 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HnrnpkP61979 463 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rras2P62071 204 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Casp3P70677 277 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc35f3Q1LZI2 421 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ube2fbQ3UWQ3 185 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EdnraQ61614 427 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifngr2Q63953 332 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp933Q6PEE4 468 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr198Q7TS40 306 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HeltQ7TS99 240 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jazf1Q80ZQ5 243 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lix1lQ8BQ89 337 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf26Q8BUH7 424 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr98Q8VFD9 309 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1163Q8VFR4 316 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NansQ99J77 359 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snapc3Q9D2C9 407 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Keg1Q9DCY0 295 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r40Q9EQ46 310 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slco1b2Q9JJL3 689 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Csnk1eQ9JMK2 416 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bpnt1Q9Z0S1 308 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv6-32A0A140T8N9 115 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm28710A0A1B0GR31 962 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930595D18RikD3Z642 64 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smpd5D6MZJ6 483 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20695H3BLK7 282 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r120K7N6J6 305 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RoraP51448 523 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ackr3P56485 362 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Doc2bP70169 412 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CbfbQ08024 187 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B4galnt1Q09200 533 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc5a6Q5U4D8 634 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rrm2bQ6PEE3 351 aa19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.8 ms