RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MITD1	Q8WV92	249 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM239	Q8WW34	195 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ASB11	Q8WXH4	323 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNAB3	O43448	404 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	AMY2B	P19961	511 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FOXJ1	Q92949	421 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SUSD3	Q96L08	255 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SPTB	P11277	2137 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SULT2B1	O00204	365 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TCF21	O43680	179 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MPC1L	P0DKB6	136 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GPNMB	Q14956	572 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MMP21	Q8N119	569 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR2AG1	Q9H205	316 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NEU3	Q9UQ49	428 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MED16	Q9Y2X0	877 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	AUP1	Q9Y679	476 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	HOXA2	O43364	376 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	STK17B	O94768	372 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CSRP3	P50461	194 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	H2BFS	P57053	126 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FKBP1B	P68106	108 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SMARCD2	Q92925	531 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SHISA3	A0PJX4	238 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC16A5	O15375	505 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GREM1	O60565	184 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SELENOF	O60613	162 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	REN	P00797	406 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF20	P17024	532 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SULT1A1	P50225	295 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	BDH1	Q02338	343 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GNMT	Q14749	295 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MPPED2	Q15777	294 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	GUK1	Q16774	197 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FUT10	Q6P4F1	479 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	LRP11	Q86VZ4	500 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SPG21	Q9NZD8	308 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SFTPC	P11686	197 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TBXA2R	P21731	343 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	LIMK1	P53667	647 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TAS2R38	P59533	333 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FOXK2	Q01167	660 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	DHRS2	Q13268	280 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PISD	Q9UG56	409 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	FEZF1	A0PJY2	475 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ETHE1	O95571	254 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	MAK	P20794	623 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TAS2R31	P59538	309 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC6A18	Q96N87	628 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	PBX4	Q9BYU1	374 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	P2RY12	Q9H244	342 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5H15	A6NDH6	313 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5H1	A6NKK0	313 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SURF4	O15260	269 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SPIN3-231	ENST00000639895	SHC2	P98077	582 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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