RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PYCR1P32322 319 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 UCNP55089 124 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 BIDP55957 195 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 C1DQ13901 141 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZS92 163 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB46Q86UZ6 589 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PROKR2Q8NFJ6 384 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ALG12Q9BV10 488 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 NUAK2Q9H093 628 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP7Q9Y680 259 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LIMS3P0CW19 117 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LIMS4P0CW20 117 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS3P57727 454 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TBR1Q16650 682 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 VASNQ6EMK4 673 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 POMGNT2Q8NAT1 580 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF649Q9BS31 505 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 MND1Q9BWT6 205 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TIGARQ9NQ88 270 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL13Q9P2N7 655 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CEPT1Q9Y6K0 416 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ACACAQ13085 2346 aa22.2■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BSA7 217 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 K7EM74 188 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TFECO14948 347 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 AHCYL1O43865 530 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TRMUO75648 421 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF24P17028 368 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC17A1Q14916 467 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF367Q7RTV3 350 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6K6Q8NGW6 343 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5M11Q96RB7 305 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 EMC6Q9BV81 110 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 B9D1Q9UPM9 204 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM129A0AVI4 362 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM171A2A8MVW0 826 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHG3P01860 377 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMB9P28065 219 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CREB3L2Q70SY1 520 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 HDDC2Q7Z4H3 204 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 MEIOBQ8N635 442 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ACBD7Q8N6N7 88 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6X1Q8NH79 312 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 LDAHQ9H6V9 325 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVK13-1Q9NX77 482 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 URB1O60287 2271 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35F4A4IF30 521 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf71A8MTZ7 269 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 MYL12BO14950 172 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 LHFPL3Q86UP9 236 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SYT14Q8NB59 555 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 OR9K2Q8NGE7 335 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 COG8Q96MW5 612 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 INPP5EQ9NRR6 644 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC16A7O60669 478 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CTLA4P16410 223 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CRABP1P29762 137 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 DOC2BQ14184 412 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 MED22Q15528 200 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TIGD6Q17RP2 521 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 LYPD4Q6UWN0 246 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRR3Q9UBC9 169 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPA2E9PIF3 369 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPA3F8WFD2 350 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TFP02787 698 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 PGA4P0DJD7 388 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 PGA3P0DJD8 388 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN17P56750 224 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SRYQ05066 204 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SPHARQ15513 63 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ROBO4Q8WZ75 1007 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD17AQ96GS6 310 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMP4Q99727 224 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 RACGAP1Q9H0H5 632 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 RERGLQ9H628 205 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 EXO5Q9H790 373 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ALPK2Q86TB3 2170 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF716A6NP11 495 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SELENOFO60613 162 aa22.16■■□□□ 1.14
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