RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00114Q6XXX2 140 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF584Q8IVC4 421 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 SKA3Q8IX90 412 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 OR5J2Q8NH18 312 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 FGFBP3Q8TAT2 258 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 YIPF5Q969M3 257 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM186Q96B77 213 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 HIF1ANQ9NWT6 349 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0A6YYJ9 748 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 FAM157AC9JC47 383 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 WNT9BO14905 357 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 TGDSO95455 350 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINA5P05154 406 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 PATE4P0C8F1 98 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 ADORA3P0DMS8 318 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 BIDP55957 195 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 WDR88Q6ZMY6 472 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 HIPK4Q8NE63 616 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM54Q969K7 222 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 OCEL1Q9H607 264 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 NARFLQ9H6Q4 476 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP13Q9UII6 198 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 CORO2BQ9UQ03 480 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf98E9PRG8 122 aa21.36■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 TFP02787 698 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 MSMBP08118 114 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 NAT2P11245 290 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 LSP1P33241 339 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 IDH3AP50213 366 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF613Q6PF04 617 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 OR6X1Q8NH79 312 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF385DQ9H6B1 395 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 TREM2Q9NZC2 230 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 GLTPQ9NZD2 209 aa21.36■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 EVPLLA8MZ36 301 aa21.35■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 NCR1O76036 304 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A24Q8N4F4 322 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 SMYD1Q8NB12 490 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 ZFAND2BQ8WV99 257 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 C7orf26Q96N11 449 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 MCHR1Q99705 422 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 EBF4Q9BQW3 602 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 LPAR2Q9HBW0 351 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 ZP4Q12836 540 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 LRFN4Q6PJG9 635 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 C12orf54Q6X4T0 127 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35D2Q76EJ3 337 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 ARHGDIGQ99819 225 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF416Q9BWM5 594 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 OR51F2Q8NH61 342 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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PTPRF-216ENST00000617451 ALKBH6Q3KRA9 238 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-216ENST00000617451 AGKQ53H12 422 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-216ENST00000617451 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRF-216ENST00000617451 PTOV1Q86YD1 416 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-216ENST00000617451 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRF-216ENST00000617451 SLC30A7Q8NEW0 376 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-216ENST00000617451 OR6T1Q8NGN1 323 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF566Q969W8 418 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-216ENST00000617451 TAAR3PQ9P1P4 343 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A23A1A5C7 686 aa21.31■■□□□ 1
PTPRF-216ENST00000617451 LYPD3O95274 346 aa21.31■■□□□ 1
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