RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 CASP12Q6UXS9 341 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.72□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 SSX8Q7RTT4 187 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 C12orf49Q9H741 205 aa8.72□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.72□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.72□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 COX10Q12887 443 aa8.71□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ITGADQ13349 1161 aa8.71□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.71□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 HIST3H3Q16695 136 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 RFX4Q33E94 735 aa8.7□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 C16orf87Q6PH81 154 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.7□□□□□ -1.02
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