RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PGA4	P0DJD7	388 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PGA3	P0DJD8	388 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPZA2	P47755	286 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	LIPE	Q05469	1076 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	NPRL3	Q12980	569 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ATR	Q13535	2644 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF566	Q969W8	418 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	TPD52L3	Q96J77	140 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SEPHS2	Q99611	448 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	RTTN	Q86VV8	2226 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200		B9A039	149 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	NME4	O00746	187 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	OR7A10	O76100	309 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	UMPS	P11172	480 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT1	P19526	365 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PCSK6	P29122	969 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	MELK	Q14680	651 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST3H3	Q16695	136 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	GSG1	Q2KHT4	349 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PLK3	Q9H4B4	646 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	LY6H	O94772	140 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL10	O95999	233 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT4	P22083	530 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	VHLL	Q6RSH7	139 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SGTB	Q96EQ0	304 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PRRC1	Q96M27	445 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CUBN	O60494	3623 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	F13B	P05160	661 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	CD79A	P11912	226 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF35	P13682	527 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	THBS4	P35443	961 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC7A2	P52569	658 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	RUNX1T1	Q06455	604 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGF	Q07326	219 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA21	Q7Z572	469 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SKA3	Q8IX90	412 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	MED31	Q9Y3C7	131 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PPP4C-205	ENST00000563200	AQP2	P41181	271 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GIPR	P48546	466 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC24C	P53992	1094 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB1A	P62820	205 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ST3GAL3	Q11203	375 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB10	Q8WXI3	467 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	LZIC	Q8WZA0	190 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM168A	Q92567	244 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM129	A0AVI4	362 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPBD1	B2RD01	187 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CXCR6	O00574	342 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FFAR1	O14842	300 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	DHH	O43323	396 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GPRIN2	O60269	458 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHG1	P01857	330 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	QDPR	P09417	244 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NR4A1	P22736	598 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GSK3B	P49841	420 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2R2B	Q00005	443 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CBLL1	Q75N03	491 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	DOK1	Q99704	481 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	INIP	Q9NRY2	104 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRG6	482 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CD5L	O43866	347 aa		18.81	■□□□□ 0.6

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