RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 TM9SF1O15321 606 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 LMX1BO60663 402 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 NPIPB7O75200 414 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 IGLV1-44P01699 117 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CHRM4P08173 479 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZNF3P17036 446 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 IL12AP29459 219 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 RYKP34925 604 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TALDO1P37837 337 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 IDH2P48735 452 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 PDLIM4P50479 330 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TMBIM6P55061 237 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 AQP4P55087 323 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 IFITM2Q01629 132 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 EPS8Q12929 822 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TRIP10Q15642 601 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 PGS1Q32NB8 556 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ATG16L1Q676U5 607 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 OGFOD2Q6N063 350 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ADCK1Q86TW2 530 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZNF563Q8TA94 476 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 HTRA1Q92743 480 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 RAB8BQ92930 207 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 DDIT4LQ96D03 193 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 GAL3ST1Q99999 423 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SIAEQ9HAT2 523 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.32□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SLC35F4A4IF30 521 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CLPXO76031 633 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 VAMP5O95183 116 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 WNT11O96014 354 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SERPINE1P05121 402 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CREB1P16220 341 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SRD5A1P18405 259 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 GIFP27352 417 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TACR3P29371 465 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 PPOXP50336 477 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TPTEP56180 551 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 OR2B6P58173 313 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 PRPS1P60891 318 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MYBPC1Q00872 1141 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CDK10Q15131 360 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MAPK11Q15759 364 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 FAM166AQ6J272 317 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 KRT80Q6KB66 452 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ANKRD46Q86W74 232 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ANKFN1Q8N957 763 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MGARPQ8TDB4 240 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 C1orf159Q96HA4 380 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MOGAT1Q96PD6 335 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 SORT1Q99523 831 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 MNTQ99583 582 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 DPY30Q9C005 99 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 NELFAQ9H3P2 528 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 PLK3Q9H4B4 646 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CA10Q9NS85 328 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 FKBP7Q9Y680 259 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.31□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 CDHR4A6H8M9 788 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 B9A039 149 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.3□□□□□ -1.24
PALB2-202ENST00000561514 KLF11O14901 512 aa7.3□□□□□ -1.24
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