RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 SLC22A20A6NK97 555 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 ZAR1LA6NP61 321 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 B8ZZF3 427 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 PRODHO43272 600 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 TBX1O43435 398 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 GPANK1O95872 356 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 MT-ATP6P00846 226 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 ADORA3P0DMS8 318 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 CLUP10909 449 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 SFTPCP11686 197 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 OSMP13725 252 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 IFNGR1P15260 489 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 GABRB1P18505 474 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 ACVR2AP27037 513 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 AGTR1P30556 359 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 GCKP35557 465 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 SELENOPP49908 381 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 SLC16A1P53985 500 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 CARD18P57730 90 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 SMIM11AP58511 58 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 CDK5Q00535 292 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 ZP4Q12836 540 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 ACKR1Q16570 336 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 C12orf73Q69YU5 71 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 OAFQ86UD1 273 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 PARP8Q8N3A8 854 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 SCAIQ8N9R8 606 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 APH1BQ8WW43 257 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 EME1Q96AY2 570 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 SARAFQ96BY9 339 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 PITX2Q99697 317 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 MED20Q9H944 212 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 KRT84Q9NSB2 600 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 Q9UFV3 132 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-211ENST00000561438 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 OR6C68A6NDL8 312 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CD8B2A6NJW9 211 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PRKYO43930 277 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CGAP01215 116 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 IGHMP01871 453 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SCG5P05408 212 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CD3EP07766 207 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ANXA8P13928 327 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ABOP16442 354 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CA7P43166 264 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 MAP2K6P52564 334 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CRISP1P54107 249 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 CTXN1P60606 82 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SLC35A1P78382 337 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 IL1RL1Q01638 556 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PUDPQ08623 228 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PMS2P3Q13401 168 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 GINS1Q14691 196 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ETFDHQ16134 617 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 MSMPQ1L6U9 139 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 PGGHGQ32M88 737 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 RFX4Q33E94 735 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 ALG10Q5BKT4 473 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 USP51Q70EK9 711 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-211ENST00000561438 GPAT4Q86UL3 456 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms