RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 AGAP5A6NIR3 686 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 GJE1A6NN92 205 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 A8MXK9 166 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 COQ9O75208 318 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 UTS2O95399 124 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 H6PDO95479 791 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 CD28P10747 220 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 PCNAP12004 261 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 CBR1P16152 277 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 PAX7P23759 505 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 ELK4P28324 431 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 STIP1P31948 543 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 GLRXP35754 106 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 PIK3CBP42338 1070 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 ASMTP46597 345 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 PRIM2P49643 509 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 BPIFB3P59826 476 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 IRF8Q02556 426 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 TGFBR3Q03167 851 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 BST1Q10588 318 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 FOXF1Q12946 379 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 CHIT1Q13231 466 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 TBRG1Q3YBR2 411 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 MMEL1Q495T6 779 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 PAGE2BQ5JRK9 111 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 KRT80Q6KB66 452 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 SLC48A1Q6P1K1 146 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 MED27Q6P2C8 311 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 LRIG3Q6UXM1 1119 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 TMPPEQ6ZT21 453 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 HSCBQ8IWL3 235 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 Q8NFD4 153 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 ZNF675Q8TD23 568 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 ST7LQ8TDW4 575 aa3.06□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 CENPHQ9H3R5 247 aa3.06□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 NOX3Q9HBY0 568 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa3.06□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 FZR1Q9UM11 496 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 OR10H1Q9Y4A9 318 aa3.06□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 PKD1P98161 4303 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 A0A087WYN8 130 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 A0A1B0GUV1 79 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 C17orf100A8MU93 164 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 CLDN25C9JDP6 229 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 RHODO00212 210 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 PLOD3O60568 738 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 LGI1O95970 557 aa3.05□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 SERPINB1P30740 379 aa3.05□□□□□ -1.92
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HERC1-211ENST00000560983 KIR2DS4P43632 304 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 GSTM5P46439 218 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 HSPA7P48741 367 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 RAP1GDS1P52306 607 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 HADHBP55084 474 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 H3F3AP84243 136 aa3.05□□□□□ -1.92
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