RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, human

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BMP4-208	ENST00000559642	FOXB1	Q99853	325 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	SMR3A	Q99954	134 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	GLTP	Q9NZD2	209 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	PLCE1	Q9P212	2302 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	DIRAS1	O95057	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	IGKV3-15	P01624	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	IGHV4-39	P01824	125 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	CD79A	P11912	226 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	HSD17B1	P14061	328 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	CBR1	P16152	277 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	GPR4	P46093	362 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	CLRN1	P58418	232 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	MYBPC1	Q00872	1141 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	AGAP6	Q5VW22	663 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	MUC15	Q8N387	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	FITM2	Q8N6M3	262 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	SYT14	Q8NB59	555 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	LIPH	Q8WWY8	451 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF347	Q96SE7	839 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	CDRT15	Q96T59	188 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BMP4-208	ENST00000559642	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642		A0A087WUU8	490 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	ARPC2	O15144	300 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	GMNN	O75496	209 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	FAM107A	O95990	144 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	IGHG1	P01857	330 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	CRYAA	P02489	173 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	QDPR	P09417	244 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	INHBB	P09529	407 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	TSPAN19	P0C672	248 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	PATE4	P0C8F1	98 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	VLDLR	P98155	873 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	PIGF	Q07326	219 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	FXN	Q16595	210 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	ALG10	Q5BKT4	473 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	FGD3	Q5JSP0	725 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF544	Q6NX49	715 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	VHLL	Q6RSH7	139 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	C16orf89	Q6UX73	402 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF627	Q7L945	461 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	C18orf12	Q96KH6	178 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	CD300A	Q9UGN4	299 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	CDC42EP2	O14613	210 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	DHH	O43323	396 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	SLC2A10	O95528	541 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	FOSL1	P15407	271 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	ACADS	P16219	412 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	ARR3	P36575	388 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	ACVR1B	P36896	505 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	HGFAC	Q04756	655 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	PRKCD	Q05655	676 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	FMOD	Q06828	376 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	FHL1	Q13642	323 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	GSG1	Q2KHT4	349 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BMP4-208	ENST00000559642	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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