RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556687.5

RBM23-222, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 2

Gene RBM23, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-222	ENST00000556687	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	LZIC	Q8WZA0	190 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	FBXO17	Q96EF6	278 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	SGTB	Q96EQ0	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	POM121	Q96HA1	1249 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	GLTP	Q9NZD2	209 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	FFAR1	O14842	300 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	BCL10	O95999	233 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	PATE4	P0C8F1	98 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	CD79A	P11912	226 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ARR3	P36575	388 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ST3GAL3	Q11203	375 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	RAB35	Q15286	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ETFDH	Q16134	617 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	VHLL	Q6RSH7	139 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	CBLL1	Q75N03	491 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF627	Q7L945	461 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	LIPH	Q8WWY8	451 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF566	Q969W8	418 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	PRRC1	Q96M27	445 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF75A	Q96N20	296 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	FOXB1	Q99853	325 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	REG4	Q9BYZ8	158 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	CA10	Q9NS85	328 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	MED31	Q9Y3C7	131 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	DHH	O43323	396 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	LY6H	O94772	140 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	SERPINA1	P01009	418 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	IGF2	P01344	180 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	IFNW1	P05000	195 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	QDPR	P09417	244 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	TSPAN19	P0C672	248 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	PGA4	P0DJD7	388 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	PGA3	P0DJD8	388 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	IFI30	P13284	250 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	PRDX6	P30041	224 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	THBS4	P35443	961 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	SERPINF1	P36955	418 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	GNGT1	P63211	74 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	CHRNB3	Q05901	458 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	GSG1	Q2KHT4	349 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	IFI44L	Q53G44	452 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	SKA3	Q8IX90	412 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	RNF148	Q8N7C7	305 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ASB10	Q8WXI3	467 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF347	Q96SE7	839 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	INIP	Q9NRY2	104 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	RTTN	Q86VV8	2226 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687		A0A1W2PRG6	482 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687		H7C417	338 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	OR4A8	P0C604	315 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	MAK	P20794	623 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	GIPR	P48546	466 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	NUDT6	P53370	316 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	RAB1A	P62820	205 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	TRAM2	Q15035	370 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	HIST3H3	Q16695	136 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	GLYAT	Q6IB77	296 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	NRM	Q8IXM6	262 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RBM23-222	ENST00000556687	SYT14	Q8NB59	555 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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