RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 DSCR9P59020 149 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 RAB40BQ12829 278 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PXKQ7Z7A4 578 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SNAPC3Q92966 411 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 MED28Q9H204 178 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PQF6 199 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CD300LBA8K4G0 201 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 GPR50Q13585 617 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 RTL8BQ17RB0 113 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 DCUN1D4Q92564 292 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 MUL1Q969V5 352 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC32Q9BV29 185 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 MTCP1P56278 107 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 EDDM3BP56851 147 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 MED30Q96HR3 178 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 HAX1O00165 279 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CNIH1O95406 144 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 OR2T7P0C7T2 308 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ASCL1P50553 236 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 CANT1Q8WVQ1 401 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 HSD17B8Q92506 261 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 TYROBPO43914 113 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRB-209ENST00000550857 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GP6Q9HCN6 339 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CTSFQ9UBX1 484 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF222Q9UK12 451 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 LNP1A1A4G5 178 aa7.35□□□□□ -1.23
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